近年来中国民营经济正经历着翻天覆地得发展,在取得骄人成绩的同时也伴随着许多亟待解决的现实问题。终极控制人为谋求自身利益利用手中控制权控制上市公司,通过关联交易转移上市公司资源,并最终达到攫取控制权私有收益的目的。关联交易的频繁发生不仅严重损害中小股东的利益,降低了企业在资本市场的诚信和盈利能力。尽管监管机构对关联交易进行监督并加大惩罚力度,但由于终极控制人行为的隐蔽性导致公司治理问题较多且难以从根本上解决。本文选取民营上市公司2007-2011五年数据作为研究对象,从终极控制人的视角实证检验终极控制人的控制权和现金流权与关联交易的关系,并分析终极控制人关联交易行为与公司绩效的关系,最后对如何减少终极控制人关联交易行为提出了相应的建议。本研究运用理论与实证检验结合的方法进行研究。理论研究主要针对民营上市公司终极控制人、关联交易以及公司绩效等相关内容,然后构建回归模型通过实证进行检验,研究结论总结如下：(1)民营上市公司中控制权和现金流权分离的结构占样本整体比例达到64.99%,同时分离结构上市公司关联交易水平明显高于两权非分离上市公司,且两权分离上市公司公司绩效(每股收益)低于两权非分离上市公司。(2)终极控制人控制权与关联交易水平呈显著正相关关系,现金流权与关联交易水平呈显著负相关关系；且随着两权分离度的增加,终极控制人关联交易逐渐增加；且当终极控制人两权分离度较大时,上市公司绩效与其关联交易规模负相关关系被加强。(3)实证发现随着关联交易水平的增加,公司每股收益水平随之降低,二者呈显著负相关关系；且在终极控制人现金流权较高的情况下,关联交易水平与两权分离度正相关关系被削弱。(4)研究发现股权制衡度能够制约终极控制人关联交易行为,从而减少终极控制人对其他股东的侵占行为。因此,上市公司应该引入更多机构投资者或者大股东对终极控制人进行有效制衡,最终提高公司绩效。