目的：通过检测新疆女性乳腺癌外周血BRCA1基因、MGMT基因各启动子区甲基化程度，探讨其与病理资料，生活环境等因素的相关性，从而达到进一步了解新疆女性乳腺癌的发病情况，为新疆地区特异性的防治乳腺癌提供策略以及科学依据。　　方法：采用1:1配比的病例对照研究，病例组为2011年在乌鲁木齐市某肿瘤医院及某三甲综合医院首次就诊、有明确的病理学诊断依据、无其他肿瘤病史及妇科疾病的新发女性乳腺癌病例；对照来自于新疆社区体检健康人群，匹配条件为：同民族、年龄±2岁，共145对。所获资料进行配对秩和检验，Spearman秩相关，单因素条件logistic回归分析。　　结果：经单因素分析结果显示：BRCA1基因PM00064862 CpG-1，CpG-3，CpG-4,BRCA1基因PM00064876 CpG-1，CpG-2,MGMT基因CpG-3，CpG-4，CpG-5各甲基化率差异有统计学意义(P<0.05)，以ER阴性阳性分组，BRCA1 PM00064862 CpG-1、CpG-3，MGMT PM00149702 CpG-3、CpG-4、CpG-5的甲基化程度差异有统计学意义(P<0.05)，以PR阴性阳性分组，BRCA1 PM00064862 CpG-1、CpG-3、CpG-4，MGMT PM00149702 CpG-1、CpG-3、CpG-4、CpG-5、CpG-6的甲基化程度差异有统计学意义(P<0.05)，按照HER-2分组，BRCA1 PM00064862 CpG-1、CpG-2、CpG-3、CpG-4，BRCA1 PM00064876 CpG-4，MGMT PM00149702 CpG-1、CpG-2、CpG-6的甲基化程度差异有统计学意义。经单因素条件Logistic回归分析结果显示：不化妆为乳腺癌发病的保护因素。使用塑料水杯，有涂层炊具，每周食用腌制次数多，烧烤次数多是乳腺癌发病的危险因素。Spearman秩相关结果显示：ER、PR与基因甲基化率呈负相关且有统计学意义，BRCA1 PM00064876 CpG-4与化妆呈正相关(r=0.232，p=0.017)，MGMT PM00149702 CpG-6与塑料饮水杯呈正相关(r=0.199，p=0.029)，其他位点均为关联性。BRCA1 PM00064862 CpG-1与每周食用腌制食品次数，MGMT PM00149702 CpG-2与每周食用烟熏食品次数呈正相关。　　结论：新疆地区女性乳腺癌发病与多方面的因素有关，运用检测外周血中BRCA1基因、MGMT基因异常甲基化状态的方法对筛查早期乳腺癌可能有意义。