FlrA调控希瓦氏菌生物膜形成的机制研究

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腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)是一类最常见的水产品腐败菌,其分布广泛、营养要求低、低温下生长较快,极易在食品加工和贮藏过程中造成腐败。由于希瓦氏菌易粘附于载体接触面形成很难去除的生物膜,在环境中留下隐蔽的污染源,威胁人类健康和环境安全。因而,在食品安全领域,控制希瓦氏菌数量、去除生物膜成为难题。对很多希瓦氏菌而言,BpfA蛋白是生物膜形成的关键的粘附素。实验室前期研究表明在有氧条件下,DosD(环二鸟苷酸环化酶)催化作用使c-di-GMP(环二鸟苷酸)水平升高,从而促进BpfA表达。本文以腐败希瓦氏菌野生型菌株S.putrefaciens CN32作为研究对象,通过laacZ报告菌株进行转座子突变,确定FlrA是bpfA操纵子重要的转录调控因子,再通过一系列实验探究FlrA具体的转录机制。通过β-半乳糖苷酶活性分析、qRT-PCR实验和生物膜表型实验进行初步验证,进一步借助EMSA、DNaseI足迹迁移实验、FP、CHIP-qPCR和定点突变等实验探究转录因子的作用机制。分析结果表明:FlrA是bpfA操纵子的转录抑制子,它结合启动子的区域覆盖-10区和-35区,同时被σ70识别。FlrA介导DosD调控bpfA操纵子的表达,环二鸟苷酸(c-di-GMP)解除FlrA与bpfA操纵子的启动子区结合。我们也发现FlhG,鞭毛合成的关键蛋白,抑制FlrA对bpfA操纵子的表达调控,并取决于FlrA。本课题研究表明在腐败希瓦氏菌CN32中,FlrA作为从环二鸟苷酸(c-di-GMP)到BpfA相关生物膜形成信号通路的关键媒介。本文通过研究影响生物膜形成的因子,探讨生物膜形成的机制,为生物膜的去除提供可调控的靶点,并为进一步研究调控生物膜的形成奠定基础。
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