目前作为治疗复杂或退行性疾病的安全、有效手段,组合药物引起了广泛关注。为了促进这方面的研究和新组合药物的发现,通过收集整理己知的组合药物应用例子,建成了组合药物数据库。此数据库的长远目标是通过分析这些己知的组合药物例子,得到一些组合药物协同相互作用模式,为进一步的理论建模和体外模拟提供基础。在本数据库中,组合药物是经过严格试验测试的,具有明确适应症和剂量关系的药物组合。组合使用的目标有以下几个方面：为了得到更好的疗效,降低不必要的毒副作用,减少或降低抗药性产生的几率,或者在增加疗效的同时减低副作用(在疗效上取得协同效果,在副作用上得到拮抗效果)。组合药物数据的来源主要有：FDA的橙皮书、己发表的研究文献和美国临床试验网站数据。目前版本的数据库中,有178个组合药物数据来自于橙皮书,另外的321个处于不同的研发阶段的组合药物分别来自于文献和临床试验报告,其中包含了40不成功的组合药物例子。对于组合药物涉及的每一个单药物组分,数据库从Drugbank、 PubChem和PubMed文献中,收集了它的药理、化学、结构和作用机制等信息。同时将单药物相关的代谢酶和靶标信息收录其中,信息包含：蛋白质序列、在细胞中的位置和功能注释信息,还有具体的三维结构等,又从PID、BioCarta和Reactome中得到靶标所对应的生物通路信息。组合药物应用的疗效信息来自于FDA的批准文件和报道此例子的文献。基于组合药物是否达到预期疗效,或相对同类药物是否有所改进,组合药物应用的疗效被归入以下两类：有效的和无效的。同时根据总体疗效和单药疗效的关系,即总体疗效是大于、等于或小于单药物加和效果,每一类又可具体分为：协同效应、加和效应或拮抗效应。一个组合药物中包含的单药物成分之间的相互作用,决定了组合药物的总体疗效,这些药物之间的相互关系,根据它们在药物治疗过程中发生作用位置的不同,将药物相互作用分为两个层次。第一层有两个类别：药物代谢动力学相互作用和药效动力学相互作用,代谢动力学相互作用是指一个药物影响了另一个的吸收、分布、代谢和排除过程,而药效动力学相互作用是指一个药物影响了另一个药效作用过程,具体体现在药物作用位点的关系上。接下来在第二个层次中,依据药物间发生影响的代谢过程,代谢动力学相互作用又可具体分为以下几个子类：增强或降低药物的转运或过膜,加强或减弱药物的分布或降低血浆水平,影响药物的分解代谢速度,加快或减慢药物的排出。根据药物作用的靶标间的关系,药效动力学相互作用可以继续分为：作用于同一个靶标,作用于同一个调控通路的不同靶标,作用于两条相互联系通路的不同靶标,作用于关系不明的两条通路的不同靶标四个子类别。通过药物间的相互作用类型,来进一步解释组合药物机理。目前版本的组合药物数据库(http://www.cls.zju.edu.cn/dcdb/)中共收录了499个组合药物数据和其517个具体应用,涉及485个单药物,6000多篇文献。针对每个组合药物数据库提供了总体药效、适应症、可能的相互作用机理和目前的研究状况信息。对于单药物提供了化学、药理学和结构信息,同时还有相关的作用靶标和代谢酶,靶标所在信号通路等信息,为了方便研究者使用还提供了到很多相关数据库的链接。通过对组合药物作用机理进行归纳分析,一些初步的药物组合规律被发现,但这些规律还需进一步深入研究。随着目前科研机构和医药公司对组合药物的持续关注,组合药物数据会持续增长。未来的组合药物数据库不但要在存储例子的数量上有所增加,还需要升级数据库的数据结构和收录的信息种类,以提高数据库的功能和数据质量,使其成为组合药物研发的综合数据资源。在组合药物数据基础之上,合理整合高通量基因表达数据和高质量分子相互作用网络,药物合理组合机理研究一定会有所突破。