改革开放以来,我国实施了一系列区域发展战略,其意在控制区域经济发展差距,实现区域协调发展。但多年的政策实践不仅未能使得东中西“梯度式”差距显著缩小,而且导致了南北分异现象进一步加剧,区域经济发展的“块状化”趋势愈加明显,而如果考虑到经济发展过程中人均意义上的福利水平差异和个人发展机会差距,则当前存在的区域发展不协调、不充分问题将尤为突出。作为新时代国家重大战略之一,践行区域协调发展战略已然刻不容缓,而推动区域市场一体化,破除要素流动壁垒,实现区域协调发展,也已成为新时代中国经济高质量发展的必由之路。在这一背景下,本文首先将市场分割带来的制度性交易成本引入具有内生增长特征的NEG框架,推导了市场分割影响区域协调发展的理论机制,发现市场分割通过阻碍区际贸易、限制市场拓展、制约企业迁移和阻滞区域发展动能转换四个层面影响了区域协调发展进程;而对比市场分割与市场一体化条件下区域发展的长期特征后发现,市场分割不仅降低了长期经济增长率和整体GDP,而且导致区际人均实际收入差距发散。为深刻分析市场分割对新时代我国区域协调发展这一具体问题的影响机制,文章进一步将区域协调发展概括为区域经济发展差距协调、基本公共服务均等化协调、基础设施通达程度协调、人民基本生活保障水平协调以及资源与环境承载能力协调五个方面,深入探讨了市场分割制约新时代我国区域协调发展的内在逻辑。其次,在理论分析的基础上,本文利用2001-2017年我国省级面板数据,测算了市场分割程度,构建区域协调发展评价指标体系,继而设计实证研究方案对理论假设进行检验。结果发现:(1)整体来看,市场分割对区域协调发展的产生了显著的阻碍作用,且随着市场分割程度的不断提高,其对区域协调发展的制约效应持续扩大。同时,市场分割对区域经济发展差距协调、基本公共服务均等化协调、基础设施通达程度协调、人民基本生活保障水平协调以及资源与环境承载能力协调均产生了不利影响,表明市场分割已然是新时代我国区域协调发展的困境和短板所在;(2)从时间层面来看,当期区域协调发展有利于推进下一期的区域协调发展进程,而市场分割对区域协调发展的影响在时间上具有显著的滞后效应,表现为在当期和滞后前三期时,市场分割对区域协调发展起到了显著的阻碍作用,但这种阻碍作用随着时间的推移逐渐变小,并最终在滞后四期时变的不显著;(3)从空间层面来看,市场分割在我国东部地区对区域协调发展的消极影响最严重,且该影响在东部地区具有空间溢出效应,而在其他区域的溢出效应不明显,进一步考察市场分割对区域协调发展的直接效应与间接效应后发现,市场分割对区域协调发展的直接效应在各区域层面均显著,但间接效应也只在东部地区显著;(4)从影响机制来看,市场分割对区域协调发展的影响具有显著的门槛特征,具体而言,当区际贸易潜力、本地市场规模和产业集聚程度越过门槛值时,市场分割对区域协调发展的阻碍作用将迅速上升,而当区域创新水平超过门槛值后,市场分割则有利于区域协调发展进程。最后,在实证研究的基础上,本文提出了消除市场分割、破解新时代我国区域协调发展困境的政策建议。