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脂肪性状是重要的经济性状，对于家禽来说一定含量的皮下脂肪使胴体外观较好；肌间脂肪会影响肉质的嫩度、风味和多汁性；而脂肪沉积过多会降低饲料转化率和经济效益。因此，对脂肪性状的研究具有重要的意义。但是目前对鸡脂肪性状的研究主要集中在QTL的微卫星全基因组扫描上，这种方法定位到的QTL区域很大，无法进行标记辅助选择，以提高育种效率。而本研究通过在别人报道的QTL基础上，用华南农业大学家鸡QTL定位资源群体，利用SNP标记，对该QTL通过基于连锁不平衡的关联分析法进行进一步的精细定位，从而找到可能的候选QTL和候选基因，为鸡的标记辅助选择奠定基础。本研究对华南农业大学杏花鸡×隐性白羽洛克鸡全同胞家系腹脂重性状两尾样本按照case-control模型进行关联分析，发现位点rs16480367和rS15687533在两尾样品中差异极显著，P值分别为0.0021和0.0022。将两个位点的P值进行100000次的重排检验后，差异仍然极显著，P值分别为0.0063和0.0082。在最小的QTL ＃2079区域虽然没有找到与脂肪性状关联显著的位点，但却发现位点rs 16480367、rs15687533、rs16481301与5周龄体重等生长性状显著或极显著相关。说明了脂肪性状和生长性状的相关性。在最大的QTL＃2073区域找到17个与腹脂重等脂肪性状关联显著的位点，且有9个点分别落到基因SPINT1、TSPAN4、TYR03、TTC17、CTNND1、PAMR1、HSPC166、STARD9、RPAP1上。初步确定该区域的20726130-21521285（约800kb）为候选QTL区域，连锁不平衡分析得出该区域的连锁不平衡有效跨度大约为430kb。定量分析表明很多基因在杏花鸡和隐性白羽洛克鸡很多组织中表达存在差异。SPINT1基因在公鸡垂体中的表达差异显著(P=0.0088);LDLRAD3在母鸡肝脏、公鸡皮脂中的表达差异显著(P=0.0352，P=0.0325)；TYOR3基因在母鸡腹脂、母鸡皮脂中的表达差异显著(P=0.0364，P=0.0099)；STARD9基因在公鸡腹脂(P<0.0001)、公鸡皮脂(P<0.0001)、公鸡肝脏(P=0.0031)和公鸡垂体(P=0.0374)中表达差异显著。综上所述，初步确定基因SPINT1、LDLRAD3、STARD9为可能的与脂肪性状相关的候选基因。