花生主茎高和分枝数QTL分析

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花生(Arachis hypogaea L.)是植物蛋白质和植物油的主要来源,具有重要的营养价值、经济价值和药用价值。栽培种花生是异源四倍体,基因数目庞大、结构复杂,其遗传研究进展缓慢。花生的株型性状是受多种因素影响的复杂的数量性状,与产量、品质息息相关,同时也是鉴定种质资源重要的形态指标。因此,选育花生的理想株型对得到改良的高产优质的新品种具有重要意义,而开展花生株型相关性状的遗传研究和QTL定位工作,是分子辅助育种的基础。本研究利用来源于花生核心种质中遗传差异大的亲本“中花10号×ICG12625”构建的RIL群体为材料,基于新开发的和已发表的SSR分子标记构建了一张遗传连锁图谱。结合连续两年的含有162个家系的F6和F7代RIL群体的主茎高、总分枝数和结果枝数的表型数据,对这些性状进行了QTL定位,本研究取得的主要结果如下。1.主茎高与分枝数的遗传分析对RIL群体F6和F7代株型相关性状进行鉴定分析,主茎高、总分枝数、结果枝数这三个性状均呈现连续变化,变异丰富。这3个性状全部符合正态分布,表现出典型的数量性状的遗传特点。不同环境下主茎高和分枝数在RIL群体中均出现了超亲分离现象。采用数量性状主基因加多基因混合遗传模型分析方法,对主茎高和分枝数进行遗传分析可知,主茎高和分枝数的遗传均受两对主基因+多基因控制。2.遗传图谱的构建基于SSR分子标记技术,以RIL群体构建的遗传连锁图谱总长为1165.45cM,含有656个标记位点,涉及20个连锁群。连锁群的长度范围为29.96cM~106.87 cM,每个连锁群平均长度为58.27cM,平均标记数为32.8个,标记间的平均间距为1.78cM。比较作图发现该图谱与参考图谱有较一致的共线性关系,能够和整合图谱的20个染色体一一对应。偏分离标记分析发现该图谱偏分离标记的成簇分布,且均偏向母本基因型。3.主茎高与分枝数的QTL分析采用复合区间作图法对进行QTL定位和遗传效应分析,两年共检测到42个与株型性状相关的QTL,分布于12个连锁群上,贡献率介于3.69%~13.04%之间。其中有6个QTL贡献率大于10%,可能为主效QTL。结果枝数相关的QTL均表现为正向加性效应,主茎高具有3个增加性状表型值的QTL,而总分枝数有有5个增加性状表型值的QTL。从QTL分布看,与主茎高和分枝数相关的QTL在连锁群上成簇分布于Lg9(6个)、Lg14(7个)、Lg15(5个)、Lg16(6个)连锁群上,为QTL热点区域。而且还存在株型不同性状的多个QTL位于同一区间的现象,如与主茎高相关的QTL qMHA02.2和与结果枝数相关的QTLqBPA02.1均位于Lg2连锁群上的AGGS2511~AGGS2388区间。这一结果与这些性状的相关性分析结果一致。不同环境下重复检测到3个与主茎高相关的QTL,qMHA04.1、qMHB04.1、qMHB04.2,而总分枝数与结果枝数未检测到重复的QTL。这些贡献率较大而且能重复检测到的QTL可以为分子标记辅助选择和精细定位研究奠定基础。
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