用SSH方法构建大肠癌脱落细胞差异表达基因的cDNA消减文库

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haicang
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目的:利用抑制性消减杂交技术(SSH)构建大肠癌患者与正常人脱落细胞差异表达基因的消减cDNA文库。 方法:选择确诊的大肠癌患者及正常人新鲜便样各15例,收集大肠的脱落细胞;分别提取总mRNA,用Smart技术反转录成cDNA;经过HaeⅢ酶切后将大肠癌患者脱落细胞cDNA分为两组并接上接头,再与过量正常人粪便脱落细胞cDNA进行两轮消减杂交及两轮抑制性PCR,使得差异表达的DNA片段得以富集;PCR产物与T/A载体连接并转化大肠杆菌JM109构建成差异表达基因的cDNA消减文库;随机挑选阳性克隆进行PCR鉴定。 结果:随机挑选375个阳性克隆进行PCR鉴定,其中有330个克隆有200~800bp的插入片段,证实建库成功。 结论:成功地构建了大肠癌患者与正常人脱落细胞差异表达基因的cDNA消减文库;对20个质粒测序结果经同源性比对分析,其中20个片段源于13个已知基因,2个克隆在GenBank中未检索到与其有相似性的基因序列。该cDNA文库的构建对于进一步筛选、克隆大肠癌脱落细胞差异表达基因及其功能研究、大肠癌早期无痛诊断、大肠癌早期诊断基因芯片的研发奠定了基础。
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