沙门菌病(Salmonellosis)是由沙门菌(Salmonella)引起的一种人畜共患传染病。沙门菌可通过被污染的饲料和水源等水平传播,也可通过患病的母畜垂直传播给子代,能够感染各种动物,引起多种畜禽疾病,如鸡伤寒、鸡副伤寒、猪副伤寒等。此外,人可通过食入被污染的肉、蛋等引起食物中毒等症状。目前,治疗沙门菌感染的有效手段主要通过疫苗和抗生素。因此,对沙门菌的流行病学进行调查及分子分型具有重要意义。为了解上海及周边地区沙门菌的流行情况,本研究分别从养殖场、超市等地采集样品641份,通过增菌液和选择性培养基分离得到疑似沙门菌,再利用PCR方法鉴定疑似菌株是否为沙门菌。然后通过检测血清型、毒力基因以及耐药性。共分离到69株沙门菌,分离率为10.76%(69/641)。在154份猪肉样品中,分离到15株沙门菌,分离率为9.7%(15/154);猪粪便样品66份,未分离到沙门菌;死鸡胚样品226份,分离到54株沙门菌,分离率为26.11%(54/226);鸡蛋样品195份,未分离到沙门菌。采用多重PCR方法,对沙门菌分离株的血清型进行了鉴定,共鉴定出鸡白痢沙门菌54株,鼠伤寒沙门菌2株,肠炎沙门菌7株,其它血清型沙门菌6株。采用K-B纸片法进行药物敏感性试验,结果显示分离菌株对克林霉素和利福平的耐药率达100%,对红霉素、氨苄西林、四环素、氯霉素、阿奇霉素、头孢拉定的耐药率均大于50%。为了解分离沙门菌株的致病力情况,采用多重PCR方法对沙门菌分离株的毒力基因进行检测。结果显示:hil A、spi A、ssa R、spi C、sif A、mgt B、mis L、spi4D、pip A、pip B、sop B、pag N基因的分布率为98.55%,spo E的分布率为92.75%,ssr A的分布率为97.10%,shd A的分布率为20.29%。用MLST和CRISPR方法对沙门菌分离株进行分型,分离的69株沙门菌共分为7个ST型,分别为ST11、ST19、ST34、ST40、ST42、ST92、ST155,其中ST92型为优势ST型;本研究所分离到的沙门菌均为CRISPR1型。综上所述,上海及周边地区的沙门菌分离率较高,其中在鸡源中主要流行鸡白痢沙门菌,猪源中主要流行肠炎沙门菌。沙门菌临床分离株含有多个毒力基因,且上海及周边地区沙门菌的分子分型大部分一致。沙门菌分离株对常用抗生素的耐药性已十分严重,应加强沙门菌的防控净化工作。