1例云南汉族大肠癌中NDRG1全长基因克隆及特征分析

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mitudierwa
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[目的]NDRG1与大肠癌的关系是转移抑制还是转移促进,近年来报道不一。本文旨在研究云南人大肠癌与高加索人大肠癌细胞中NDRG1基因有无差异,并在mRNA水平观察NDRG1在云南人及高加索人大肠癌细胞中的表达特点。[方法]收集云南人大肠癌患者的腹水,并进行细胞培养及传代。设计NDRG1基因引物,提取云南人大肠癌细胞的总RNA,进行RT-PCR,然后进行琼脂糖凝胶电泳和基因测序。利用生物信息学和高加索人大肠癌细胞系及云南人大肠癌细胞,通过实时荧光定量PCR,在mRNA水平观察NDRG1在云南人及高加索人大肠癌细胞中的表达特点。[结果]根据琼脂糖凝胶电泳显示扩出正确的NDRG1基因,全长大约1185bp,本文用以参比的核酸序列来源于http;//www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM001135242.1公布的NDRG1序列,通过双向测序,我们确定了所得序列为云南人大肠癌细胞NDRG1全长序列,开放阅读框长度1185bp,编码394个氨基酸。通过NCBI在线BLAST软件对比,我们所得结果与网上上传NDRG1核酸序列完全相同,提示在核酸序列水平,云南人和高加索人NDRG1无差异。由实时荧光定量PCR的结果来看,在mRNA水平,云南人NDRG1的表达高于高加索人。[结论]NDRG1基因在不同人中核酸序列相同,在不同人结肠癌细胞中mRNA表达水平有差异。
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