本研究利用华南农业大学林学院林木育种教研室自主选育的火炬松×加勒比松杂种(火加松)F1代群体中的117个单株，通过开发火炬松EST、EST-CAPS、EST-SNP等多种标记，结合前期已得到的分子标记，分别对亲本火炬松和加勒比松构建遗传图谱。并以作图群体为基础，对所得的标记进行QTL检测。并根据火加松的生长数据，分别对火炬松和加勒比松的重要生长和形质性状进行了QTL定位。论文研究的结果总结如下：　　1.利用火炬松的EST数据库开发引物732对，其中501对引物能够成功扩增出产物，本身固有多态性的有53对，酶切多态性引物有14对，HRM检测EST-SNP共得到13对多态性引物。　　2.群体检测得到74个EST多态性位点，结合前期所得到的标记，共计378个。其中父本杂合位点有227个，母本杂合位点269个。利用这些标记构建的父本加勒比松图谱包含103个标记，分成24个连锁群，总长度1043.7cM，标记平均间距10.13cM，基于火炬松的EST标记有17个上图。母本火炬松图谱包含115个标记，分成32个连锁群，总长度1256.6cM，标记平均间距10.9cM，基于火炬松的EST标记有26个上图。　　3.利用本研究所得到的标记，对火炬松和加勒比松的生长和形质性状进行QTL定位。生长性状包括2年生树高、3年生树高、3年生胸径、5年生胸径、5年生树高和07-08年的树高生长量。形质性状包括2年生时抽稍次数、平均冠幅、树干通直度、春梢分枝数、春梢平均分枝角度、春梢平均分枝直径、平均针叶长、每100个针叶束中2、3、4、5针针叶束的数量，共17个性状。　　4.通过QTL作图，在17个性状上一共检测到32个在Kruskal-Wallis检验和区间作图上都达到0.1的显著性水平的QTL位点，其中有多个位点与多个性状连锁。这些QTL位点解释表型方差的比例在3.3％到49.1％之间不等，这既表明了微效多基因效应存在，同时也说明有主效基因效应存在。其中，生长性状在Kruskal-Wallis检验和区间作图中都达到0.1显著性水平的QTL位点有16个，在干形形质性状上共定位到了5个QTL位点，在侧枝形质性状上，只在BRA07上定位到3个QTL位点，对于07年春梢平均针叶长度AVPNL，在Kruskal-Wallis检验和区间作图中都达到0.1显著性水平的位点有8个，在针叶性状上总共定位了12个QTL位点。