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本研究从新疆传统药用植物骆驼刺(Alhagi pseudalhagi Desv)内生菌中筛选出一株对玉米大斑病菌(Exserohilum turcicum)和玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)具有较强抑制活性的拮抗内生细菌XJAS-AB-13,根据生理生化特征、16SrDNA序列将XJAS-AB-13鉴定为Bacillus.subtilis (GeneBank注册号：JF826131)。对病原真菌宿主植物活体(SC-704号玉米)检测新筛选出的骆驼刺拮抗内生细菌XJAS-AB-13和本实验室已筛选的拮抗内生细菌XJAS-AB-11发酵液对玉米大小斑点病菌的抑制活性,研究表明,其中XJAS-AB-13发酵液对玉米大斑和小斑病菌防病效率分别为63.33%和45%,分别达0.1%多菌灵防病率的80.85%和64.28%。XJAS-AB-11发酵液对玉米大斑和小斑病菌防病效率分别为23.33%和58.34%,分别达0.1%多菌灵防病率的29.78%和83.34%。防御酶活性测定结果表明,拮抗菌发酵液能减轻玉米斑点病菌侵染玉米叶片时的毒素含量,有效地防治病情发生。通过硅胶柱层析对拮抗内生细菌XJAS-AB-11发酵液活性部位乙酸乙酯萃取物进行分离纯化,最终得到两种单体,其命名为XJAS-B和XJAS-G。根据1HNMR和13CNMR波谱数据以及ESI-MS分子量将XJAS-B和XJAS-G分别鉴定为环[D-亮氨酰-4-羟基-L-脯氨酸]二肽和4H-1-苯并吡喃4,2-(3,4-二羟基苯基)-3,5,7-三羟基黄酮(槲皮素)。按照Bacillus subtilis BSn5假定柚皮查尔酮合酶基因序列设计的Bsn引物和文献查到的Bacillus subtilis bcsA-ypbQ操纵子查尔酮合酶基因BpsA引物分别对XJAS-AB-11查尔酮合酶基因(黄酮类化合物合成途径的关键酶)进行PCR扩增,对BpsA扩增的PCR产物进行TA克隆,测序比对分别获得823bp(Bsn)和1014bp(BpsA)的查尔酮基因部分序列。对BpsA引物扩增TA克隆测序后的XJAS-AB-11查尔酮合酶氨基酸序列进行分析,XJAS-AB-11查尔酮合酶氨基酸序列与已实验验证的放线菌Streptomyces griseus查尔酮合酶、紫花苜蓿Medicago sativa查尔酮合酶malonyl-CoA结合亚基(ExPDB:1cm1A)、花生Arachis hypogaea苯乙烯合成酶(ExPDB:1z1eA)以及非洲菊Gerbera hybrida的查尔酮合酶蛋白序列具有较高的同源性。不同物种查尔酮合酶活性部位氨基酸序列(实验验证的)与XJAS-AB-11CHS氨基酸序列ClustalW2比对显示XJAS-AB-11CHS氨基酸序列含有与放线菌Streptomyces griseus查尔酮合酶活性部位氨基酸相似的氨基酸序列。据文献报道,XJAS-B及其结构类似物具有较强的抗菌和癌细胞增殖抑制活性,且XJAS-G具有较强的抗菌活性。本研究结果对于新型天然药物资源的开发利用以及取代对药用植物的采伐或对其进行资源保护有一定的现实意义。此外,在阐明内生菌代谢物活性成分的合成机制、分析和揭示植物内生菌与宿主间的基因水平转移或其它寄生关系等方面具有一定的参考价值。