本试验旨在研究纯种柯乐猪、巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪肠道微生物差异性及肠道微生物差异性对耐粗饲特性的影响,通过分析结肠纤维降解菌差异性,测定结肠内容物SCFA含量、结肠组织SCFA受体（GPR41和GPR43）及转运蛋白（MCT1和MCT4）m RNA的相对表达量,进行耐粗饲能力比较分析,为杂交组合的筛选打下基础。主要研究结果如下:1.苏×柯杂交猪空肠菌群丰富度高于纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪,苏×柯杂交猪回肠菌群丰富度高于纯种柯乐猪;厚壁菌门和变形菌门为纯种柯乐猪、巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪小肠中的优势菌门,乳杆菌属为三者小肠中的优势菌属。2.厚壁菌门和拟杆菌门为纯种柯乐猪、巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪结肠优势菌门,三者猪结肠中均发现了普氏菌属、链球菌属、密螺旋体属、拟普雷沃菌属、瘤胃球菌属等纤维降解菌属。巴×柯杂交猪结肠月形单胞菌属的相对丰度显著高于纯种柯乐猪（P<0.05）,消化球菌属、考拉杆菌属、聚乙酸菌属、Leeia的相对丰度显著低于纯种柯乐猪（P<0.05）;毛螺菌属在纯种柯乐猪结肠的相对丰度趋势高于巴×柯杂交猪（P=0.056）;消化球菌属、考拉杆菌属在苏×柯杂交猪结肠的相对丰度趋势高于巴×柯杂交猪（P=0.06,P=0.09）;粪球菌属、Butyricicoccus在纯种柯乐猪结肠的相对丰度趋势高于苏×柯杂交猪（P=0.0502,P=0.078）。对纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪结肠菌群进行LEf Se分析,纯种柯乐猪结肠富集着大量的产短链脂肪酸菌群,其中纤维降解菌有聚乙酸菌属、不可培养瘤胃细菌4C0d＿17（uncultured＿rumen＿bacterium＿4C0d＿17）、Leeia、拟杆菌纲、拟杆菌目,与纤维降解菌起协同作用的菌群有考拉杆菌属、考拉杆菌属的uncultured＿Veillonellaceae＿bacterium;巴×柯杂交猪结肠富集的纤维降解菌群有月形单胞菌属、柔嫩梭菌;对纯种柯乐猪和苏×柯杂交猪结肠菌群进行LEf Se分析,纯种柯乐猪结肠富集的纤维降解菌有粪球菌属、拟杆菌门、拟杆菌目、拟杆菌纲、瘤胃梭菌属的Anaerostipes＿hadrus和普雷沃菌属的Sinorhizobium＿sp＿GL28,苏×柯杂交猪结肠富集的纤维降解菌有密螺旋体属的Treponema＿porcinum。对巴×柯杂交猪与苏×柯杂交猪结肠菌群进行LEf Se分析,苏×柯杂交猪结肠中富集有Terrisporobacter的uncultured＿Clostridium＿sp。表明结肠中纯种柯乐猪纤维降解菌相对丰度最高,苏×柯杂交猪次之,巴×柯杂交猪较低。测定结肠肠道内容物短链脂肪酸含量,纯种柯乐猪、巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪差异不显著（P>0.05）。3.GPR41和GPR43基因在纯种柯乐猪结肠组织表达量显著高于巴×柯杂交猪（P<0.05）,MCT1基因在纯种柯乐猪结肠组织表达量显著高于巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪（P<0.05）。综上所述,纯种柯乐猪、巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪结肠中纤维降解菌相对丰度表现出差异,纯种柯乐猪最高,苏×柯杂交猪次之,巴×柯杂交猪较低,纯种柯乐猪结肠SCFA吸收利用相关基因表达量显著高于巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪,巴×柯杂交猪和苏×柯杂交猪基因表达量差异不显著,说明纯种柯乐猪耐粗饲能力最强,苏×柯杂交猪对粗纤维的消化能力强于巴×柯杂交猪。