环状RNA的差异表达与急性髓系白血病预后关系的研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:morpheus
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目的:CircRNA在急性髓系白血病的发生发展过程中发挥重要作用。本文旨在利用GEO数据库分析circRNA的差异表达与急性髓系白血病预后关系。方法:利用在线数据库GEO下载AML患者样本,以NCCN指南作为分组依据,将上述样本划分为高危AML和低中危AML两组。利用R软件中的“edgeR”筛选出存在差异表达的circRNA/miRNA/mRNA。再通过R软件中的“survival”包对在高危AML与低中危AML两个组别中存在差异表达的circRNA进行生存分析,并构建ceRNA网络。通过对不同分组病人的研究进行对相关circRNA的验证。结果:由GEO数据库中的circRNA/miRNA/mRNA表达数据,综合分析得出27个经典的 circRNA(hsa-circ-0001764、hsa-circ-2445023、hsa-circ-1362851、hsa-circ-0001097、hsa-circ-0135651、hsa-circ-6273091、hsa-circ-0034693、hsa-circ-0021550、hsa-circ-1294922、hsa-circ-0035426、hsa-circ-0033902、hsa-circ-0001224、hsa-circ-0006609、hsa-circ-0012742、hsa-circ-0065667、hsa-circ-0001228、hsa-circ-0001664、hsa-circ-0016609、hsa-circ-0001247、hsa-circ-0009224、hsa-circ-1453431、hsa-circ-0005524、hsa-circ-0001255、hsa-circ-0003381、hsa-circ-0083137、hsa-circ-0001749、hsa-circ-0230341)与 AML 患者预后具有显著的相关性,并且构建了与这些circRNA相关的ceRNA网络。除此之外,还进行了两者之间存在差异表达的mRNAs的GO和KEGG通路分析。结论:这些 circRNA(hsa-circ-0001764、hsa-circ-2445023、hsa-circ-1362851、hsa-circ-0001097、hsa-circ-0135651、hsa-circ-6273091、hsa-circ-0034693、hsa-circ-0021550、hsa-circ-1294922、hsa-circ-0035426、hsa-circ-0033902、hsa-circ-0001224、hsa-circ-0006609、hsa-circ-0012742、hsa-circ-0065667、hsa-circ-0001228、hsa-circ-0001664、hsa-circ-0016609、hsa-circ-0001247、hsa-circ-0009224、hsa-circ-1453431、hsa-circ-0005524、hsa-circ-0001255、hsa-circ-0003381、hsa-circ-0083137、hsa-circ-0001749、hsa-circ-0230341)在 AML高危和低中危组别中存在差异表达,可能对AML的预后判断有意义,为今后AML的治疗提供新的可能的靶点及新的思路。
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