七叶一枝花中重楼皂苷合成相关基因的筛选和功能分析

来源 :中南民族大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fuji2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
七叶一枝花(Paris polyphylla var.Chinensis)是百合科重楼属植物,其根状茎为中药重楼的正品药源之一。七叶一枝花的根状茎具有多种活性成分,其中最重要的是重楼皂苷。当前,我国制药工业对重楼皂苷的市场供需缺口较大,这是因为包括七叶一枝花在内的多种野生重楼资源已濒临枯竭,且其人工繁育的周期长。为了缓解七叶一枝花的资源危机,满足制药工业对重楼皂苷的需求,利用合成生物学手段进行人工调控重楼皂苷的合成,已是当前的研究热点。然而,重楼皂苷的生物合成途径尚未完全解析。为了深入了解重楼皂苷的生物合成信息,本研究通过对七叶一枝花的多组织混合样本进行PacBio转录组测序分析,初步筛选出与重楼皂苷合成相关的候选基因并研究其表达特征,结合进化树分析,进一步筛选出2个可能与重楼皂苷合成相关的候选基因,在获得候选基因c DNA全长的基础上,对其进行了原核表达。本研究结果不仅为后期体外蛋白的催化验证等实验提供材料基础,同时也为解析重楼皂苷生物合成途径提供方向,本文取得的研究成果如下:(1)以七叶一枝花的根状茎、茎、叶、花、果荚及种子6个部位为样品,对其c DNA混合样本进行PacBio测序,获得52537个平均长度为2607 bp的高质量Isoform,将所得序列进行NR、Nt、KEGG、Swissprot和GO等数据库注释后,共注释得到了40725条Isoform,占所有鉴定到Isoform的77.52%;对所有高质量Isoform进行CDS预测,共得到39342个CDS,这些CDS的平均长度达到759 bp;此外,SSR分析表明,上述Isoform中的双核苷酸重复数最多,达到9925个。(2)根据全长转录组数据的KEGG分析结果,本研究筛选出12步重楼皂苷合成途径中的关键候选基因,随后分别提取七叶一枝花的根、根状茎、茎、叶、花和种子共6个组织的RNA样品,利用q RT-PCR技术,对筛选出的12步候选基因进行表达量分析。结果显示,12步候选基因中,有2个基因在所有组织中表达量均较低,3个基因主要在根状茎中表达,2个在花中表达量较高,3个在茎和叶中均高表达,另外2个在叶中高表达。(3)进一步利用生物信息学方法,对重楼皂苷合成下游途径中的糖基转移酶基因进行深入分析,从而筛选出45个尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)的候选基因,其中31个UGTs的C末端具有糖基转移酶特征盒子PSPG box。对上述45个UGT基因的蛋白产物进行理化性质分析和二级结构预测,结果表明45个UGT蛋白多为酸性蛋白质,长度在46~479个氨基酸之间。进化树分析显示,七叶一枝花中的45个UGTs基因主要分布在A、D、G、L、K组中,其中与皂苷合成相关的D组中有15个基因分布,UGT80亚组中有1个基因分布。表达量分析显示,45个UGTs中7个基因在根状茎中表达量显著上调,6个基因在叶中表达量显著上调,10个基因在茎中表达量显著上调,5个基因在种子中表达量显著上调,4个基因在花中表达量显著上调,13个基因在根中表达量显著上调。(4)利用电子克隆技术拼接出长度大于1000 bp且聚类于D组的2个UGTs基因的全长(PpUGT01和PpUGT42)。生物信息学分析表明,PpUGT01的c DNA全长为1485 bp,编码的蛋白长度为492 aa,编码产物的相对分子量为53836.69 Da,等电点为5.73,其不稳定指数和脂肪指数分别为34.22和90.22,该蛋白为亲水性蛋白,不存在跨膜结构域和信号肽。PpUGT42的c DNA全长为1446 bp,编码的蛋白的长度为482 aa,编码产物相对分子量为53241.54 Da,等电点为5.53,不稳定指数为47.38,脂肪指数为90.15,该蛋白为亲水性蛋白,不存在跨膜结构和信号肽。(5)分别构建PpUGT01和PpUGT42的原核表达载体,将其在大肠杆菌中进行原核表达分析。结果表明,PpUGT01在16℃下,以1 m M的IPTG进行诱导,16 h后,可以获得该蛋白的可溶性表达产物。PpUGT42在37℃下,以1 m M的IPTG进行诱导,4 h后,检测到了该蛋白的可溶性表达产物。综上,PpUGT01和PpUGT42在大肠杆菌中均可顺利表达,且表现为可溶性蛋白。(6)以薯蓣皂苷元和偏诺皂苷元为底物,尿苷二磷酸葡萄糖、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸和尿苷二磷酸半乳糖为糖基供体,将PpUGT42的粗酶液在30℃条件下进行酶促反应12 h。反应产物用高效液相色谱检测,结果显示PpUGT42的粗酶液在该条件下未能催化薯蓣皂苷元及偏诺皂苷元发生糖基化反应。
其他文献
随着社会电能应用水平的提高,家庭用电设备种类逐渐增多,居民的用电量剧增,电气火灾事故频发,以至于低压线路中的用电安全和能耗分析倍受关注。故障电弧是引发低压线路下电气火灾的重要原因之一,由于目前我国对串联故障电弧的检测设备并不完善,电气火灾监控系统对居民用电的分析功能欠缺,因此本文将电气火灾监控系统和智能电网中的非侵入式负荷辨识技术相结合,基于低压线路中串联故障电弧的特性和不同家用负荷信息的差异性,
荜茇为胡椒科植物荜茇(Piper longum L.)的干燥近成熟或成熟果穗,又名荜拔、荜拔梨、鼠尾等。荜茇味辛,性热,归胃、大肠经,具有温中散寒,下气止痛之功效,常用来治疗脘腹冷痛,呕吐,胸痹心痛,头痛,牙痛,消化道和生殖系统的炎症等。本论文研究荜茇中的化学成分及其生物活性,为荜茇的进一步研究和开发应用提供科学依据。本论文采用溶剂提取法,正、反相硅胶柱色谱法,葡聚糖凝胶LH-20,半制备高效液相
滇重楼是传统药用植物,野生资源匮乏。人工种植是解决滇重楼药源紧缺的有效途径,但许多人工种植品存在品质下降的问题。利用内生菌保障和改良中药植物品质是当前研究的热点之一。本研究以人工种植的5年生滇重楼为对象,采用Illumina Miseq测序技术和微生物培养技术分别分析根茎、茎和叶3种组织总内生真菌及可培养内生真菌的多样性及菌群特征,以及分析与重楼皂苷含量相关的内生真菌(属);通过与小麦幼苗共培养筛
人脸识别是计算机视觉和人工智能领域最重要的研究方向之一。随着大数据时代的逐步到来,各大媒体数据有了井喷式的增加,人脸识别的需求也在随之增加。传统的人脸识别技术只能解决小规模人脸识别问题,在面对大量人脸图片时的实时性非常低,而且在单机环境下训练效率低下、人脸数据存储困难。因此,如何能够快速、准确的从大量的人脸图像中识别出一个人的信息成为当前人脸识别技术的主要研究方向。为解决以上问题,本文进行以下研究
直播作为一项新兴娱乐模式,越来越受到用户的欢迎。随着直播的发展与普及,大量实时的直播在线评论——弹幕随之产生。这些弹幕不仅与直播的内容相关,而且具有在线实时性、语言简略与互联网化的特征,容易产生一些新的网络流行词汇;同时,用户间的实时交互影响彼此的表达方式和情绪。因此,弹幕一般承载着用户的各种观点,能够及时准确的反映用户在观看直播时的情感状态。对弹幕文本进行情感分析,挖掘出具有价值的情感信息,能够
透明导电电极是有机发光二极管(OLED)的重要组成部分,其性能直接影响OLED的发光效果,因此,研究电极的性能具有重要意义。针对氧化铟锡存在易脆、铟资源稀缺等问题,提出一种WO3(三氧化钨)/Ag(银)/PEI(聚乙烯亚胺)/Cu SCN(硫氰化亚铜)(WAPC)叠层结构电极;采用传输矩阵理论模拟电极的光学性能,通过旋涂法和真空蒸镀法制备WAPC叠层透明电极。主要内容包括:(1)采用传输矩阵理论模
从上世纪90年代末以来,随着高校的大扩招,高等教育由精英阶层逐渐走向大众化。我国进行正式备案招生的高等院校达到了2914所。随着高校的大扩招,全国各地利用此契机纷纷建设大学城、文教区[1],目前国内规划建设的大学城多达50多座,涉及21个省、市,大学城成为城市的重要组成部分影响城市形态和功能布局。在教育产业化、后勤社会化的大背景下,我国大学城规划建设明确提出了开放性和共享性的理念,但新建的校园和城
随着我国景观照明工程的飞速发展,近代建筑夜景经济价值也逐渐被发掘出来。借助灯光,近代建筑得以在夜间延续其“生命力”,使城市的夜晚变得更加丰富多彩。本文将汉口地区的近代西式建筑景观照明研究对象,以主观评价的方式进行近代建筑夜间景观照明效果主观评价研究。本文在绪论部分对我国近代建筑以及城市景观照明的发展历程进行论述,并对目前国内外西洋风格历史建筑的夜间景观照明相关法规和理论进行梳理,列举了当下与我国近
目前,电容式电压互感器(Capacitor Voltage Transformer,CVT)主要用于为电力系统的计量、保护和控制装置提供可靠的低压信号,且工频条件下具有较高的准确度。然而,由于CVT内部储能元件和非线性元件的存在,CVT的暂态响应误差大,难以满足电网高幅值、宽频域暂态电压的测量需求。因此,需建立准确的CVT电磁暂态物理模型以实现CVT在复杂暂态下的频率响应模拟,为电力系统电能计量和
区域供冷供热系统为可再生能源的应用提供了条件,有助于推动中国能源结构转型,降低温室气体排放,实现可持续发展的长远利益。但区域供冷供热系统在实际运行中存在着初投资大、运行费高的问题。基于以上背景,本文对区域供冷供热系统的一次管网机房阻力、二次管网管径以及管道绝热厚度进行优化研究,提出优化措施和优化方法,编制管网优化程序,从而提高区域供冷供热系统的经济性,降低设计难度,推动区域供冷供热系统的发展。冷热