急性肝衰竭小鼠回肠、结肠以及粪便菌群变化的研究

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目的:探讨急性肝衰竭小鼠肠道微生态菌群的变化,寻找特征性差异菌,为急性肝衰竭肠道微生态紊乱的诊治提供依据。方法:BALB/c雄鼠30只(空白组5只,模型组25只),D-氨基半乳糖制造小鼠急性肝衰竭模型。提取小鼠下消化道不同节段(回肠、结肠)内容物及粪便的微生物DNA,进行PCR扩增,对16S V3-V4区进行高通量测序,利用生物信息学分析技术对测序结果进行OTU聚类,物种注释,α多样性分析,LEf Se(LDA Effect Size)分析,寻找模型组特征性差异菌。结果:2组小鼠,共存活10只,其中模型组死亡率为80%。回肠、结肠内容物及粪便共30个样本,测序覆盖深度>97%。α多样性分析显示急性肝衰竭小鼠回肠中细菌丰度增加(chao1指数105.7±18.4与149.3±55,P<0.01),多样性增加(shannon指数2.5±0.1与2.8±0.8,P<0.05);结肠中细菌丰度减低(chao1指数285.4±46.1与276.98±46.7,P<0.05)及多样性增加(shannon指数4.9±0.3与5.65±0.39,P<0.01),粪便中细菌多样性降低(shannon指数5.1±0.3与4.87±0.29,P<0.01),丰度(chao1指数270.1±53.7与250.2±54.4,P=0.067)无显著差异。模型组肠道菌群与空白组相比小鼠肠道中检测到10个菌门,以厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门为主。模型组回肠中细菌门水平差异无统计学意义;结肠中拟杆菌门比例增加(9.3%±7.9%与33.8%±18.2%,P=0.024<0.05),TM7菌门比例增加(0.2%±0.3%与2.2%±1.6%,P=0.029<0.05);粪便中厚壁菌门减少(32.8%±20.5%与10.2%±5.5%,P=0.05)、拟杆菌门增加(57.3%±23.4%与86.1%±67.2%,P=0.07),但差异无统计学意义。在最佳分类水平上,回肠梭菌科丰度减少(44.95%±19.28%与7.51%±16.57%,P<0.05),结肠理研菌科(1.08%±1.01%与4.18%±2.39%,P<0.05)、S24-7(4.75%±4.87%与22.77%±13.05%,P<0.05)、F16(0.24%±0.28%与2.18%±1.61%,P<0.05)等丰度增加。LEf Se(LDA Effect Size)分析显示两组在葡萄球菌科、S24-7方面差异有统计学意义,其中S24-7可定义为特征性差异菌群。结论:不同节段肠道拥有不同的肠道菌群结构,急性肝衰竭小鼠肠道微生态紊乱,回肠菌群过度生长。急性肝衰竭与S24-7过度生长有相关性。
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