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水稻的株型、穗型和粒型是水稻重要的农艺性状,影响水稻的产量与品质。株型、穗型和粒型的改良对培育优质高产水稻具有重要作用。由于这些性状大部分是数量性状,易受环境因素影响,鉴定控制这些性状表达稳定的QTL,并开发相应的分子标记应用于标记辅助选择育种具有重要意义。本研究在实验室前期研究工作基础上,利用以昌恢121为背景的越光染色体片段置换系群体,在海南和南昌两个试验地点对株型、穗型和粒型性状进行QTL检测及其稳定性分析,主要结果如下:1、两地共检测到42个与株型相关的QTL,其中株高、剑叶长、剑叶宽、剑叶夹角和有效分蘖数的QTL分别有11、5、7、12和7个。有2个控制株高的QTL(qPH-1、qPH-2)、3个控制剑叶夹角的QTL(qLW-1、qLW-4、qLW-5)和1个控制有效分蘖数的QTL(qTN-8)在两个试验地点都被检测到,其中qPH-1和qPH-2的平均LOD值分别为5.07和3.25,平均贡献率分别为5.31%和3.28%。qLW-1、qLW-4和qLW-5的平均LOD值分别为5、4.48和13.62,平均贡献率分别为6.23%、6.66%和16.75%。qTN-8的平均LOD值为5.4,平均贡献率为3.92%。分析染色体片段置换系群体各株系,发现编号为X82的株系含有qLW-1的代换片段,其剑叶宽在2个环境下均表现偏向越光,即剑叶宽度变窄。2、两个试验地点共检测到26个与穗型相关的QTL,其中穗长、一次枝梗数、二次枝梗数和结实率的QTL分别有7、3、8和8个。位于第12染色体上控制结实率的QTL(qSSR-12)在两个试验地点都被检测到,平均LOD值为4.06,平均贡献率为4.25%。3、两个试验地点共检测到34个与粒型相关的QTL,其中粒长、粒宽和千粒重的QTL分别为11、16和7个。在两个试验地点稳定表达的QTL有9个,其中3个控制粒长的QTL(qGL-3、qGL-1-2、qGL-12)、4个控制粒宽的QTL(qGW-2-1、qGW-2-2、qGW-3-1、qGW-3-2),2个控制千粒重的QTL(qTGW-3、qTGW-7)。GL-3、qGL-1-2和qGL-12的平均LOD值分别为3.66、17.26和5.12,平均贡献率分别为20.94%、3.7%和5.25%,qGW-2-1、qGW-2-2、qGW-3-1和qGW-3-2的平均LOD值分别为15.51、58.39、4.47和9.63,平均贡献率分别为6.24%、40.23%、1.55%和3.59%。qTGW-3和qTGW-7的平均LOD值分别为3.65和3.29,平均贡献率分别为5.81%和5.44%。分析染色体片段置换系群体各株系,发现编号为X85与X121的株系含有qGL-3的代换片段,粒长表现变窄。编号为X8与X9的株系含有qGL-12的代换片段,其粒长在2个环境下均表现偏向越光,即粒长都变窄。4、2016年在南昌进行了控制落粒性的QTL分析,共检测到6个QTL,分布于2、3、9和12号染色体上,LOD值介于3-25.4之间,单个QTL的贡献率介于3.7%-41.5%之间。