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肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)广泛存在于水体、土壤等微生态环境中,易在住院患者呼吸道和肠道定植,当患者机体免疫力低下时,可引起呼吸道、泌尿道、消化道及皮肤软组织等多部位感染,是医院感染最常见的致病菌之一。2010年开始,深圳市建立了“重要病原菌医院感染暴发监测系统”,覆盖哨点医院11家,重点监测肺炎克雷伯菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐万古霉素肠球菌等引起院内感染暴发的病原菌。为了解深圳地区肺炎克雷伯菌的医院感染暴发菌株和耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)临床分离株的耐药性、毒力因子分布和克隆特点等病原学特征,本研究对来自11家哨点医院的69株菌株,包括16起疑似肺炎克雷伯菌院内感染暴发的60株菌株和9株CRKP菌株,采用脉冲场凝胶电泳技术(Pulse field gel electrophoresis,PFGE)和基于全基因组测序的单核苷酸多态性分析技术(Single Nucleotide Polymorphism-Whole genome sequencing,WGS-SNP)分析菌株的同源性,在此基础上采用药敏试验、高黏液表型试验、常见荚膜血清型试验和毒力基因检测(wabG,kfuBC,rmpA,rmpA2,entB,ureA,uge,FimH,ycfM和aerobactin),并利用耐药基因库开展菌株的耐药和毒力特征研究。本研究对16起疑似医院感染暴发的60株菌株进行WGS-SNP分析,确认共有4起暴发,包括ST1933-XDRKP血流感染暴发、ST14-XDRKP血流感染暴发、ST1411-MDRKP呼吸道感染暴发和ST11型CRKP医院感染暴发,其科室分布在新生儿重症监护室(Neonatal Intensive Care Unit,NICU)、新生儿科、泌尿科、神经内科、急诊病房和重症监护室(Intensive Care Unit,ICU)。四起医院感染暴发的19株暴发菌株对头孢他啶、美罗培南、亚胺培南、氨曲南和哌拉西林/他唑巴坦的耐药率要显著高于41株散发菌株,CRKP主要分布在康复医学科。60株菌株主要的CTX-M基因型为CTX-M-15;9株CRKP菌株主要的CTX-M基因型为CTX-M-15和CTX-M-3。41株散发菌株携带毒力基因aerobactin、rmpA和rmpA2基因。CRKP仅携带rmpA2基因。69株菌株中还未发现耐碳青霉烯类-高致病性肺炎克雷伯菌菌株,但在41例散发病例中的儿科病房发现携带高黏液表型-耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem-Resistant hypermucouscovis Klebsiella pneumoniae,CR-HMKP)菌株。本次研究显示来自“深圳市重要病原菌医院感染暴发监测系统”的19株暴发菌株和41株散发菌株都以(Clone Complex 11,CC11)克隆群为主。9株CRKP菌株主要以CC147为主。19株暴发菌株对头孢西丁和头孢哌酮/舒巴坦敏感性好,提示可优先选用这两种抗生素进行治疗;41株散发菌株对头孢西丁的敏感性好,提示优先选用该抗生素进行治疗。为控制肺炎克雷伯菌引起的医院感染暴发,本研究表明需要重点监控NICU、新生儿科、泌尿科、神经内科、急诊病房、ICU以及康复医学科。