云南高原湖泊T4类浮游病毒遗传多样性研究

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浮游病毒(Virioplankton)是淡水水体中种类最丰富,丰度最高的生物类群。本研究从云南省10个湖泊采集了11个水样,并对采样点进行了环境因子的检测,发现水温、营养水平等因素并不直接影响浮游病毒的丰度,但是可能通过影响浮游藻类和其他病毒宿主而间接影响浮游病毒的丰度。 本实验应用分子生物学方法;浓缩病毒、提取病毒核酸、扩增g23基因片段、克隆测序等,对云南的高原湖泊浮游病毒的多样性进行了研究。对11个不同营养水平的湖泊样品得到的序列进行系统进化分析、g23蛋白水平分析、不同营养水平组内发散度分析。所有序列建立系统进化树,挑取每个样品中有代表性的类群与已知的T4类病毒序列建立系统进化树进行系统进化分析,C1(茈碧湖)与C3(洱海才村)处于同一个分支,这说明这两个丛的序列相似性比较高,在这两个湖泊中某些T4浮游病毒的同源关系很接近。此外C10(杞麓湖)与C1(茈碧湖)和C3(洱海才村)在同一个分支上,这显示三个湖泊的T4型浮游病毒也表现出一定的同源性。C2(碧塔海)与肠杆菌噬菌体处于一个分支,这说明在高海拔地区也有与肠杆菌噬菌体同源的噬菌体的分布,更进一步表明浮游病毒分布的广泛性。显示C5与C11的序列相似度很高并且与Syn19同源性比较高。将这些湖泊分为贫营养、中富营养、轻度富营养以及中度富营养四组,组内发散度分析发现,营养水平的差异和湖泊的空间位置都将对浮游病毒多样性产生影响。
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