国家实行创新驱动的发展战略,这是我国由经济大国向经济强国迈进的根本途径。创新驱动战略的基础在科技协同创新,而科技协同创新的落脚点在产业协同创新。区域产业协同创新是促进产业发展的有效路径。区域产业协同创新要落到实处,关键在于找到适合投资的产业协同创新项目。协同创新项目已经成为区域产业发展的主流形式和重要载体。选择合适的产业协同创新项目是促进区域产业协同创新的关键。本文在总结相关理论的基础上,梳理了目前我国区域产业协同创新项目发展的现状和存在的问题,建立了一套区域产业协同创新项目选择评价指标体系,提出了相配套的基于综合云模型的评价方法。并以湖南战略性新兴产业新材料产业协同创新项目选择为例,说明了指标体系和方法的实用性。研究结果如下：1)区域产业协同创新项目可以界定为：在政府政策引导或市场需求下,区域内不同产业之间或同一产业内的相关创新主体通过优势互补、资源有效利用,共同创新相关产业的新技术、新方法、新工艺、新产品,以促进区域内产业做大做强的协同创新项目。2)区域产业协同创新项目选择的原则除了一般性的原则外,还要考虑国家意志原则、市场准入原则、技术自主原则、产业关联原则、就业带动原则和资源环境原则。3)区域产业协同创新项目选择的评价指标包括：项目的先进度、项目符合区域发展规划与政策的程度、项目促进区域产业升级优化前景、项目与现有产业的匹配度、项目的预期效益、项目完成的基础等6个方面。4)项目评价模型使用云模型,可以充分考虑评价专家给出的评价信息的模糊性和不确定性,保证了评价结果的客观性。