两型包虫病特异性外周血游离miRNAs的筛选及生物信息学分析

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目的:初步筛选两型包虫病患者血浆特异性mi RNAs。方法:收集泡型包虫病患者(AE)、囊型包虫病患者(CE)及健康志愿者血浆各3例,利用mi RNA微阵列芯片检测三组血浆mi RNA表达谱,分析三组之间两两比较差异的mi RNAs以及AE和CE患者与健康志愿者比较表达均存在差异的mi RNAs,并对mi RNAs进行靶基因预测及GO功能富集分析、KEGG通路分析,将差异mi RNAs与重点的调控基因构建网络关系图,筛选出核心mi RNAs。结果:通过mi RNA微阵列芯片检测,发现AE患者与健康志愿者比较,表达差异的mi RNAs共有144种,其中69种表达上调,75种表达下调;CE患者与健康志愿者比较,差异表达的mi RNAs共有30种,其中12种表达上调,18种表达下调;AE和CE患者与健康志愿者比较表达均存在差异的mi RNAs共有17种,其中4种表达上调,13种表达下调;AE患者与CE患者比较表达差异的mi RNAs有21种,其中1种表达上调,20种表达下调。生物信息学分析后发现4种mi RNAs(hsa-mi R-24-3p、hsa-mi R-328-3p、hsa-mi R-148b-3p及hsa-mi R-671-5p)是两型棘球蚴在人体内生存微环境调节的关键mi RNAs;7种mi RNAs(hsami R-17-5p、hsa-mi R-20b-5p、hsa-mi R-20a-5p、hsa-mi R-15a-5p、hsa-mi R-16-5p、hsa-mi R-107及hsa-mi R-26b-5p)是泡球蚴在人体内生存及致病的关键mi RNAs;1种mi RNA(hsa-mi R-96-5p)是囊型棘球蚴在人体内生存及致病的关键mi RNAs。结论:通过mi RNA微阵列芯片检测及生物信息学分析我们初步筛选出4种AE和CE患者与健康志愿者比较均存在显著差异的mi RNAs,7种泡型包虫病特异性的mi RNAs以及1种囊型包虫病特异性的mi RNA,这些mi RNAs在包虫病的早期诊断、包虫病的病理机制的研究及潜在治疗靶点的探究方面具有重要的意义。
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