广西猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5~7基因的克隆、序列分析及分子流行病学调查研究

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本研究通过RT-PCR方法对广西不同地方疑似PRRS的病料进行检测,发现精液、流产死胎、淋巴结、肾脏均能检出PRRSV,说明除肺脏外,病毒还可以在其他组织中存在。通过对精液和流产死胎毒株的ORF5基因进行克隆和序列分析,发现核苷酸和氨基酸同源性为100%,进一步证实PRRS可以通过感染PRRSV的精液进行垂直传播。 对PRRS阳性病料ORF5~7基因的全长序列克隆和序列分析,得到12个ORF5基因,8个ORF6基因和5个ORF7基因,结果表明与CH-1a、HB-1、FJ-1、BJ-4、VR-2332、疫苗株等毒株相比的ORF5、ORF6、ORF7基因的核苷酸同源性为87.2~97.3%、90.1~97.9%、90.1~98.4%,氨基酸同源性为85.1~96.0%、92.0~97.1%、87.9~96.8%。与LV株序列相比核苷酸分别为62.2~64.0%、68.2~68.8%、65.6~67.5%,氨基酸同源性分别为55.7~56.2%、75.9~78.2%、55.6~58.9%。遗传进化树表明广西流行毒株分别属于3个亚群Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ,本研究的12株属于Ⅱ亚群,除GXWX株在ORF5基因进化树中与美国准种变异代表株B2亲缘关系较近外,其他毒株3个基因的进化树均与HB-1株的亲缘关系较近,推断广西流行毒株可能源于同一毒株。推导编码氨基酸序列分析发现,12个毒株与疫苗株无相关,均源自野毒株;除GXWX外,其余11株均具有准种特征;主要抗原表位发生变异,
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