本文运用系统动力学和合作博弈分析了“公司+农户”规模经营运行的动力机制,发现公司和农户在参与“公司+农户”经营模式中实现了双赢。通过静态博弈模型揭示了“公司+农户”模式违约问题的根本原因是市场风险的存在,并得出了稳定的“公司+农户”模式的价格波动区间。为寻求“公司+农户”经营模式的风险外化通道,引入期货、期货期权对“公司+农户”模式进行优化,提出了“公司+农户+期货”和“公司+农户+期货、期货期权”优化模式并通过博弈模型进行分析。同时,提出了基模生成集核和基模核的概念,建立了刻画“公司+农户+期货、期货期权”经营模式的系统动力学流率基本入树模型,利用强简化流率基本入树模型作嵌运算生成极小基模核,由极小基模核构成基模生成集核,由基模生成集核生成具有典型意义的基模核并施行从流率基本入树模型至强简化入树模型的逆变换生成“公司+农户+期货、期货期权”经营模式的具有典型意义的基模进行反馈分析；这为复杂系统的基模反馈分析提供了一个更为简洁的方法。并通过总体流图分析得出：“公司+农户+期货、期货期权”经营模式对来自市场风险、市场需求和价格的制约具有反制约作用,土地问题是制约该模式的主要因素。