高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌分子特征解析

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ankang1989
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景和目的:  肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是一种条件致病菌,主要感染糖尿病或恶性肿瘤等免疫功能低下或免疫缺陷的病人,其导致广泛的感染,包括肺炎,尿路感染,菌血症和脑膜炎等。根据致病特征及毒力特点,可将其分为两大类,即普通肺炎克雷伯菌(classic Klebsiella pneumoniae,cKP)和高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKP)。最近《柳叶刀感染病》(The Lancet Infectious Diseases)杂志报道了2016年在中国东南地区某医院,携带blaKPC-2的 ST11高毒力肺炎克雷伯菌院内爆发一文,该文引起广泛关注。经典的ST11碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌通过获得约170kb的pLVPK毒力质粒后,表现出高毒力。此研究表明一个惊人的进化事件:质粒介导的多重耐药和高毒力趋向在同一个主要流行的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌中进行克隆传播,如ST11。由于耐碳青霉烯的hvKP菌株可能在健康个体中引起严重的不可治愈的感染,所以这些菌株的出现对公众健康构成重大威胁。本次研究设计针对hvKP克隆以及流行的 ST11 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)克隆的一个快速检测方法,用这个方法了解温州地区分子流行情况,研究高毒力碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌(HV-CRKP)毒力质粒的特征及主要流行的克隆分布;明确毒力基因与高黏液表型的关系,以及新型抗生素头孢他啶-阿维巴坦复合制剂对HV-CRKP的抑制效果。采用全基因组测序分析的水平进一步探索其分子进化。本研究覆盖了检测、治疗及分子进化三方面。  方法:  我们设计了三个多重PCR(PCR-I,II和III),PCR-I能够快速检测和鉴别流行性碳青霉烯耐药菌株的常见ST型,包括:ST258、ST11、 ST23、ST86和ST65菌株。PCR-II鉴别与ST23、ST86和ST65菌株相关的KL1及KL2以及ST11相关的KL47和KL64 K-loci分型。此外,PCRIII用于检测毒力质粒pLVKP携带的四种毒力基因和一个的复制子基因。我们使用设计的多重 PCR 方法回顾性筛选了 152 株临床肺炎克雷伯菌菌株。为了进一步探讨 KL64,KL47 是否携带pLVPK类似的毒力质粒,我们使用 GelJ软件分析S1-PFGE两者的质粒谱,明确两者之间质粒谱关系。通过Southern blot对rmpA基因进行定位。使用Illumina Nexseq 500 测序平台对定位到的质粒测序,进一步明确KL64,KL47是否携带pLVPK类似的毒力质粒,以及该质粒与pLVPK的区别。我们通过蜡螟幼虫感染模型以及血清杀伤试验来明确携带pLVPK类似的毒力质粒KL64,KL47菌株在毒力上的区别。最后我们使用肉汤稀释法检测 HV-CRKP 对头孢他啶 - 阿维巴坦的MIC。  结果:  通过对已知全基因组序列的76株肺炎克雷伯菌对多重PCR进行验证,结果显示与MLST以及WGS结果100%一致。在PCR-II中,肺炎克雷伯菌ST23分离株对应KL1为阳性,在174bp有特异性扩增条带。而ST86,ST65分离株KL2为阳性,在451bp有特异性扩增条带。 PCR-III用来检测与pLVKP类似的毒力质粒相关的4个毒力基因。 结果显示,ST23,ST65和ST86菌株均有5条特异性扩增条带,分别对应四个毒力基因(rmpA,rmpA2,iutA和iroN)和质粒复制子IncHIB。ST258菌株没有携带任何毒力基因。结果与WGS分析结果一致。我们使用设计的多重PCR方法回顾性筛选了152株临床肺炎克雷伯菌菌株。其中 104 株碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌株分离自住院患者,48 株肺炎克雷伯菌收集于临床门诊。ST11 型的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌对应的两种 KL 分型KL47、KL64都能够携带毒力质粒p-LVKP相关的毒力基因。  经S1核酸酶消化后,23株菌的 PFGE电泳图谱显示11 株 KL47 和12 株KL64的菌株中都存在2-3个质粒。进一步杂交显示,KL47 rmpA基因都定位在质粒上,大小近似,约~210kb。KL64 rmpA基因都定位在质粒上,~210kb,大小一样。与毒力质粒pLVPK(AY378100)进行了同源比对,所有23株ST11碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌全部携带与pLVK类似的质粒,该质粒与pLVPK质粒的大部分同源。通过系统进化树分析,中国现阶段分离的 ST11 常见的 KL 型为KL47和KL64。而欧美等地ST11的KL主要有KL24、KL15、KL27、KL24等。KL64和KL47属于两个不同的分支,这两种都能携带pLVPK类似的毒力质粒。  蜡螟幼虫感染模型,24小时后 KL64存活率约为45%, KL47存活率约为80%。7天后KL64存活率约为20%,KL47存活率约为45%。血清杀伤实验与人嗜中性粒细胞孵育3小时后,KL47存活率低于15%,KL64的存活率80%。  用肉汤稀释法检测 HV-CRKP 对头孢他啶 - 阿维巴坦的 MIC。结果显示携带碳青霉烯酶的菌株对头孢他啶耐药。 但是,当与阿维巴坦合用时,头孢他啶的MIC显着降低。头孢他啶-阿维巴坦和头孢他啶MIC50分别为0.5μg/ ml和128μg/ ml,头孢他啶-阿维巴坦的MIC90为1μg/ ml。加入4μg/ ml阿维巴坦后,头孢他啶对碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌的MIC90降低了256倍。  结论:  1. 我们首先发现了 KL64 携带 pLVPK 类似的毒力质粒。ST11 型HV-CRKP的KL可见于KL64和KL47,这两型分别可获得pLVPK类似的毒力质粒。  2. KL64 HV-CRKP的毒力比KL47 HV-CRKP高,如果只靠经典的粘液丝试验判断高毒力菌株,很有可能会漏检。  3. 头孢他啶-阿维巴坦对治疗携带KPC的高毒力肺炎克雷伯菌疗效好,具有应对迫切的满足的医疗需求的潜力。
其他文献
看到张韬的《最后的皮影》,心中喜忧参半。喜在这门古老的民间艺术终于引起人们的关注,而忧在于它目前的生存状态和发展前景的确并不乐观,引人深思。皮影,一直被誉为中国民间
在分析目前综合保护系统存在的问题的基础上,设计了一种新型的智能化保护系统,重点分析了系统的基本保护原理,介绍了硬件和软件框图。现场运行表明该保护系统性能稳定,动作可靠,具
科技部部长徐冠华在日前召开的河南省科技大会上宣布河南省成为全国首家“科技富民工程”试点省,先期进行“科技富民工程”试点工作.rn
目的: 通过测量肝脏不同常见病变磁共振扩散成像(DWI)图像的表面扩散系数(ADC值),综合量化分析肝脏常见局灶性病变的磁共振影像特点。 材料和方法: 1、选择10例健康者作
目的:通过骨髓间充质干细胞(MSCs)与阿霉素(ADR)损伤心肌细胞共培养体系的建立,模拟MSCs移植的心肌病微环境,观察MSCs对ADR损伤心肌细胞的凋亡的影响,并探讨其作用机制。 方法
本文通过对《湖北日报》会议新闻报道的现状的研究,发现其存在的问题,并提出了可供借鉴的意见。通过翔实的事例、数据,引导该报进行会议新闻改革,精简会议新闻报道,写出精炼
目的:探讨玻璃体切除联合眼内填充术治疗复杂性视网膜脱离,可能与术后高眼压发生相关的因素及术后短时间(一周内)继发高眼压临床降眼压药物的合理应用。 方法:对133例(135眼)复
背景与目的: 急性白血病(acute Leukemia,AL)是以不成熟(原始、早幼)造血细胞恶性克隆增殖为特征的血液病。其病程凶险,是高发恶性肿瘤之一。在儿童及35岁以下成年人恶性肿瘤死
【摘要】当前经济发展飞速,网络信息技术在各领域应用广泛,金融犯罪手段越来越复杂化,洗钱活动也出现明显的跨国性趋势,公安机关在打击跨国洗钱犯罪时存在立案难、跨境查证难、国际司法协助难与处理难等问题。为了有效打击跨国洗钱犯罪,本文从国际法的视角,分析跨国洗钱方式的特点,提出加强国际合作、建立国际情报信息库、遏制洗钱犯罪减少经济损失等对策。  【关键词】国际法跨国洗钱反洗钱经济犯罪金融  洗钱一词由来已
患儿女,8岁。全身紫红色斑疹、丘疹、斑块8年。全身可见散在分布绿豆至钱币大紫红色斑疹、丘疹、斑块、褐色色素沉着斑及白色萎缩性色素减退斑。腹部丘疹样皮损病理示真皮乳