近几年来，我国民办高等教育发展越来越迅速。随着办学规模的扩大和办学理念的不断更新，民办高校的一些财务管理体系已经不能适应发展的需求。这其中存在着很多问题，如何采取有效措施强化民办高校的财务管理已经是一个迫在眉睫的任务。本文通过将定性与定量分析方法相结合，探讨了与民办高校财务管理体系密切相关的问题，对优化民办高校财务管理体系进行了有益的探索。本文首先在深入分析了我国民办高校财务管理研究意义的基础之上，借鉴国内外研究成果，明确了研究的思路和方法。其次，在对民办高校和民办高校财务管理概念的内涵阐述的前提下，从委托代理理论、风险收益均衡理论、权变理论和业务流程再造理论等相关理论入手，初步探讨了各个理论对民办高校财务管理的权责分配、风险控制、组织结构和资源安排等方面的作用，为之后的研究提供了理论上的铺垫。然后，结合我国民办高校财务管理的现状，笔者发现了其中存在的内部治理结构失衡、出资方式不够规范、经费来源渠道单一、会计监督职能弱化以及预算管理体制滞后等问题，并利用相关民办高校的财务数据对这些问题的成因进行了深层次的研究。接着将美国和日本的私立大学的财务管理方法与我国的情况进行了对比，得出了一些经验和启示。最后，从优化民办高校财务管理环境和构建内部财务管理体制两个方面提出了具有一定的实践性和操作性的建议，对于完善我国民办高校财务管理体系有很重要的借鉴意义。