随着我国社会经济的发展,传统的全面预算管理已不适应现代企业管理体系,越来越多的企业和企业将平衡计分卡引入到企业的管理体系中,收到比较好的效果。由于行政事业单位的特殊性,目前还未将平衡计分卡引入到行政事业单位的管理体系中。随着社会发展和行政事业单位职能转变,行政事业单位现行预算管理的局限性在其内部管理中已经显现,其应有的服务和管理社会的公共职能得不到充分发挥。本文采用实证研究和文献研究的方法,以R事业单位为研究对象,研究其应用基于平衡计分卡的全面预算管理体系的必然性和可执行性。通过对R事业单位往年预决算管理过程和内容的分析,找到了其在运行传统预算管理体系过程中存在的问题,并使用平衡计分卡作为改进传统预算管理的工具,从战略层角度重新设计预算管理体系的内容,使预算更加符合战略要求,更贴近实际。本文重点解决了 R单位存在的预算与战略目标脱节、经费分配不均匀、预决算存在较大差异、单位预算与年终考核关联度不强等问题。通过建立基于平衡计分卡的全面预算管理体系、从战略目标到预算管理的体系设计以及对其应用提出了相关建议,使R单位预算管理能力得到提升。本文还尝试将基于平衡计分卡的R单位全面预算管理体系推广至整个系统内,寻求建立适合所有事业单位的基本模型。