番茄抗黄化曲叶病基因Ty-2的精细定位及不同抗性基因效应比较

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由番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)引起的番茄黄化曲叶病是番茄生产中世界性的重要病害之一。利用野生资源中的抗性基因选育抗病品种是最根本的解决办法。目前从野生番茄中定位到5个抗性基因:Ty-1、Ty-2、Ty-3、Ty-4和Ty-5,并通过分子标记辅助选择培育出了一些抗病品种;但是由于目前得到的分子标记与目的基因的遗传距离仍然较远,在育种中存在不良性状连锁、假阳性和抗源材料丢失等问题。因此,对抗性基因进一步精细定位并克隆,对于明确番茄抗病机制和抗病育种都具有重要的意义。含有单一抗性基因的品种在病害大规模发生时抗性容易下降,研究不同基因的聚合效应对于抗病品种选育具有重要意义。Ty-2基因是来源于野生多毛番茄‘B6013’的单个显性基因,最初被定位到番茄第11号染色体长臂末端TG36和TG393之间约19cM的距离内,后来被进一步定位到标记C2_At2g28250和T0302之间6.7cM范围内。本研究在前人研究的基础上,对Ty-2基因进行了精细定位,以期为克隆该基因和提高标记辅助育种效率提供分子依据。同时对Ty-2、Ty-3和Ty-4不同基因的抗性水平进行了研究,为获得高抗TYLCV品种选育提供技术支撑和理论依据。主要研究结果如下:1.基于番茄基因组相关序列,利用BatchPrimer设计了242对引物,同时合成了Tomato-EXPEN遗传图谱上已知标记引物18对,对抗病纯合体E951-7、抗病杂合体TyQueen和感病纯合体Horizon进行基因型验证,筛选得到56个多态性标记,其中包括16个SCAR标记和40个CAPS标记。选取在染色体上均匀分布的21个标记,构建了目的区域的高密度遗传图谱,标记之间的平均遗传距离为0.05cM。2.以来源于H24杂交种H9205的11000个F4代单株为材料,筛选出在侧翼分子标记C2_At1g07960和T0302之间发生重组的单株157个,对这些重组单株的后代进行基因型和烟粉虱接种鉴定,其结果将Ty-2基因精细定位到分子标记UP8和M1之间,遗传距离0.4cM。在精细定位的过程中,获得了一个与Ty-2基因紧密连锁的共显性SCAR标记P1-16,在抗、感病对照材料中分别可扩增出300bp和600bp的片段,并利用48个不同的番茄转育品系对该标记进行了验证,发现P1-16的带型与TYLCV抗性一致。该标记可以用于Ty-2基因的辅助选择。3.以测序番茄品种S.lycopersicum H1706的基因组为参考序列,在Ty-2基因侧翼标记UP8和M1之间300kb的区域预测到了35个基因。其中Solyc11g069620.1、Solyc11g069660.1、Solyc11g069670.1、Solyc11g069920.1和Solyc11g069930.1具有植物抗病基因典型的NB-ARC结构,位于重组发生的位点,将这5个基因作为Ty-2的候选基因。4.利用栽培番茄8083、含有Ty-2基因纯合片段的近等基因系E846和同时含有Ty-3和Ty-4纯合片段的材料Fla.726构建群体,从中筛选出了14个含有不同抗性基因组合的材料,并用TYLCV-IL株系进行了抗性鉴定。结果表明,只含有Ty-2、Ty-3、Ty-4基因的植株分别表现为抗、中抗和感病;同时含有Ty-2和Ty-3或者Ty-2和Ty-4基因的植株均表现抗病;同时含有Ty-3和Ty-4基因的植株表现中抗;不同基因之间的抗性表现出累加效应,含有这3个基因的材料抗病效果最好。
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