营养胁迫条件下牦牛皮下脂肪和背肌差异microRNAs的筛选与鉴定

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 6次 | 上传用户:tanleilei
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牦牛(Bos gruniens)分布在青藏高原及其毗邻的高海拔地区,由于受高海拔条件及非地带性高原山地气候的制约,牦牛体内脂肪和肌肉呈现“波浪式”的消长方式。在牧草充足的暖季,牦牛体重迅速增长,体内肌肉及脂肪组织都得到快速生长与囤积;而在冷季,在长达7个月的枯草期后体重下降至暖季的70%左右,体内肌肉与脂肪组织均大量消耗。本研究采用高通量测序技术,研究冷季及暖季末期牦牛皮下脂肪及肌肉组织中差异表达的micro RNA及其功能,以探索micro RNA在营养胁迫下对牦牛脂肪及肌肉代谢平衡的调控作用。研究结果如下:1.构建冷季皮下脂、暖季皮下脂、冷季背最长肌以及暖季背最长肌四个小RNA文库,经Solexa测序得到的纯净读数均为24M。在四个文库中,长度为22 nt的micro RNA数量最多。2.在牦牛皮下脂肪micro RNA文库中,鉴定到450个micro RNA,其中70个micro RNA在两个季节皮下脂肪组织的表达量达到差异显著水平(P<0.05)。在表达差异显著的micro RNA中,mi R-335、mi R-378b、mi R-200a、mi R-200b、mi R-200c及mi R-210对牦牛脂肪代谢起到调控作用。3.在牦牛背最长肌micro RNA文库中,鉴定到344个micro RNA。79个micro RNA在两个季节背最长肌组织中的表达量达到差异显著水平(P<0.05),其中mi R-133b、mi R-378、mi R-378c、mi R-29a、mi R-29b和mi R-29c对牦牛肌肉代谢起到调控作用。4.皮下脂肪组织差异表达micro RNA预测到815个达到显著水平的靶基因,显著富集在脂肪细胞生成与代谢、脂肪酸的合成与分解等77个通路中(P<0.05);背最长肌组织共预测到1315个达到显著水平的靶基因,靶基因在骨骼肌发育、蛋白质合成及氨基酸生成等99个通路中显著富集(P<0.05)。综上所述,本研究通过Solexa高通量测序,筛选冷暖两季牦牛皮下脂肪及背最长肌组织micro RNAs并对其分子代谢通路进行研究,探索在冷季营养匮乏的胁迫下,micro RNAs对牦牛脂肪及肌肉代谢的重要调控作用,为诠释micro RNA在季节性环境变化下形成的特殊脂肪及肌肉代谢过程的调控作用提供了一定的科学依据和理论支撑。
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