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本试验旨在研究奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎感染后基因的表达变化。运用基因表达谱芯片和实时荧光定量PCR技术对差异表达基因进行筛选、分析和验证,从而找出奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎免疫应答过程中的关键候选基因。本试验选取了3头中国荷斯坦奶牛作为供试奶牛,利用金黄色葡萄球菌人工感染其乳腺,并观察感染后奶牛的全身反应,感染后24h,利用临床诊断、奶牛乳中体细胞计数等方法诊断奶牛成功感染乳腺炎后,采用外科手术的办法采集供试奶牛乳腺组织样本,利用Agilent牛基因组表达谱芯片分析供试奶牛乳腺组织全基因组范围内的基因差异表达结果,利用Q-PCR技术对基因芯片的结果进行验证分析,并对芯片结果及Q-PCR结果进行关联性分析。同时对差异表达基因进行GO和Pathway等功能分析,主要结果如下：1、基因表达谱芯片分析共筛选出显著差异表达基因297个,其中188个基因上调表达,109个基因下调表达(FC>2,P<0.05)。2、对差异表达基因进行GO分析,发现这些基因共涉及到151个GO Terms (GO注释)(P<0.05)。3、对差异表达基因进行Pathway分析,共筛选到15条显著的Pathway,分别是：造血细胞谱系、细胞因子,细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、主要的免疫缺陷、MAPK信号通路、T细胞受体信号通路、抗原加工和呈递、B细胞受体信号通路、肠道免疫网络的IgA的产生、Wnt信号通路、PPAR信号通路、Toll样受体信号通路、JAK-STAT信号通路、血管内皮生长因子信号通路。4、对这些Pathway进行网络图分析,共发现了32个枢纽表达基因:BoLA-DRB3、BoLA-DRA、BLA-DQB、CSF3、CTLA-4、PIK3R3、TGFB、FASLG、LSC126945、MAP2K1、 MAP2K3、EPAS1、GNA12、PRKACB、TCF7、GNB、TWIST2、IL17A、IL4R、IL1R2、 NOS2、SELE、ZAP70、JAM3、CD80、CD3D、TLR8、NCF1、LOC509513、MMP2、FCGR1A、WNT2,这些基因可作为奶牛乳腺炎抗性研究候选基因群。5、在297个差异基因中,挑选了8个显著差异表达的基因(C3、TLR8、BoLA-DRB3、 PTX3、CSF3、SLC11A1、CD80、IL17A),利用Q-PCR技术对其进行定量分析,并将其结果与基因芯片结果进行关联性分析,发现Q-PCR与基因芯片结果一致。