新医改是2009年3月17日中共中央、国务院面向全国公布了深化医药卫生体制改革的意见。《意见》提出了有效减轻居民就医费用负担,切实缓解“看病难、看病贵”的近期目标,以及建立健全覆盖城乡居民的基本医疗卫生制度,为群众提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务的长远目标。公立医院一直以来的管理制度都比较落后,缺乏内部和外部的约束机制,在粗放的管理模式下运营成本越来越高,再加上普遍存在的浪费现象,医院的运营和发展不容乐观。医疗改革制度的进一步深化,打破了公立医院“以药养医”的传统格局,如何在激烈的市场环境下,更好的生存和发展,保持其公益性和盈利能力,在这个新时代的背景下对公立医院提出新的挑战。全面预算管理在市场经济中发挥了重要作用,是一种早已在市场广泛应用的管理办法,在企业管理中被广泛应用并且成果显著,经受住了实践和时间的检验。结合公立医院的现状以及面临的挑战,也应该将全面预算管理理论进行应用,改善医院的运营状态。本文结合新的医疗制度改革的要求,考虑J公立医院的实际状况,将全面预算管理进行实际应用。首先,对J公立医院的现行的全面预算管理现状进行分析,对于J公立医院的现状进行问题诊断,并且深入研究这些问题。其次,针对发现的问题和不足,将J公立医院现行的全面预算方案进行全新的优化设计,考虑了全面预算管理的多个方面,应用BSC平衡计分卡设计了适用于J公立医院的全面预算管理绩效考评体系。最后,本文提出了针对性的保障措施,使J医院在经过优化的全面预算管理下,继续健康、良性的发展,满足医疗制度改革在新时代提出的新要求。