近年来,研究人员发现人类生命活动早期的微生物群落不仅对新生儿的生理发育至关重要,同时也对他们未来的健康有深远的影响。菌群异常可以通过引起免疫系统以及代谢系统的紊乱使新生儿疾病,同时也会增大新生儿成年后患病的概率。人体微生物受多种影响,处于一个动态变化的过程,而各种与微生物相关的健康状态,以及微生物与健康之间的联系仍未被探索,人类微生物来自哪里,仍有待研究。卵泡液发育成熟排出健康的卵子,卵子与精子相遇结合形成受精卵,人的生命就此展开。经阴道采集的卵泡液中发现微生物,表明卵泡液微生物可能是特发性不孕症或不良人工辅助受精的夫妇不孕症调查的相关重点。卵泡液微生物可能在受精和胚胎发育中有重要作用,研究人工辅助受精患者的卵泡液中是否存在微生物,有助于人们解决人工辅助受精难题,为不孕不育的治疗提供有效策略。母亲是新生儿细菌的主要来源,但尚不清楚母婴传播是发生在出生前、出生中还是出生后。同样,分娩方式对新生儿微生物的影响也一直是争议的焦点。了解新生儿肠道微生物的组成和来源以及分娩方式对新生儿微生物组成的影响,对婴儿、儿童和成人的健康有重要意义。因此,本研究的实验内容和结果如下:第一,应用高通量测序技术研究人工辅助受精患者卵泡液中的细菌群落特征,了解其演替规律。从云南省第一人民医院采集101例人工辅助受精患者卵泡液（52例继发性不孕和49例原发性不孕）,所有样品由医生使用负压针取出,采样过程未受到阴道微生物污染。提取总基因组DNA,扩增目的片段并进行高通量测序,得出以下结论:（1）人工辅助受精患者卵泡液中确实存在微生物,并且继发性不孕和原发性不孕症患者卵泡液中微生物存在差异;（2）在门的水平上,继发性不孕症患者的卵泡液样品中,Proteobacteria和Firmicutes的丰度较高,原发性不孕症患者卵泡液中Planctomycetes的丰度最高;（3）在属的水平上,两组样品也存在差异,继发性不孕症患者中主要以Lactobacillus和Gardnerella为主,在原发性不孕症患者中,主要以Abiotrophia、Streptomyces和Lactobacillus为主;（4）基于OTU的系统发育分析发现,丰度最高的Lactobacillus和Pseudonocardia存在于所有的样品中,而Atopobium vaginae strain DNF00180只存在于原发性不孕症患者的卵泡液中。第二,选取了36例阴道分娩、42例剖宫产分娩的母婴对,采集其胎便、胎盘、胎膜、羊水、阴道、直肠和口腔样品共计550份,分析全部样品的细菌群落多样性。通过对大量样品和序列进行比较,并进行严格的阴性对照,得出以下重要结论:（1）新生儿样品包括胎便、胎盘和胎膜中都存在微生物群落,并且同一新生儿样品中的微生物群落高度相似。（2）胎便、胎盘和胎膜中的细菌群落分布与分娩方式无关。由于取样方法的限制,羊水样品确实与分娩方式有关。阴道分娩的羊水细菌群落与阴道样品比较接近。（3）对于大约一半的胎盘微生物,同样的序列可以在母亲的阴道、直肠和口腔样品中发现。（4）尽管非常罕见,产甲烷菌在胎儿妊娠系统中确实存在。