杨梅基因组SSR标记开发和雄株遗传多样性分析

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuehan3269
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
杨梅(Myrica rubra)属于杨梅科(Myricaceae)杨梅属,起源于我国,其种质资源丰富,有2000多年的栽培历史。杨梅营养价值高,是天然的绿色保健食品,市场潜力巨大。本研究基于杨梅全基因组鸟枪测序结果开发了大量SSR标记,为以后杨梅遗传图谱构建及育种提供理论依据,并从分子水平上探讨我国杨梅雄株种质资源的遗传多样性及其育种用途,主要研究结果如下:1.基于杨梅基因组测序的SSR标记开发首次对杨梅进行全基因组鸟枪测序及初步分析,共获得9.01Gb序列信息,预测其基因组大小约为323Mb,覆盖深度为26x,其基因组杂合度较高,重复序列含量较低;测序后经拼接获得序列总长度达255Mb,其中包含28,602个SSR位点(重复次数≥5),以二核苷酸重复单元类型为主,所占比例为84.73%,三核苷酸重复单元类型占13.78%,四核苷酸重复单元类型占1.34%,五核苷酸重复单元类型及六核苷酸重复单元类型分别占0.12%,0.04%。我们设计并合成600对SSR引物,其中186对具有多态性,从中选择158对用于分析评价29份杨梅及3份近缘种材料的遗传亲缘关系,发现SSR引物在近缘种青杨梅、矮杨梅及蜡杨梅中具有一定的通用性,分别为91.14%,89.87%与46.84%。采用UPGMA对以上所有样品进行聚类分析,结果表明来源于我国西南地区的青杨梅与矮杨梅亲缘关系较近,而来源于美国的蜡杨梅与其它样品亲缘关系最远且划分为一个独立的分支。2.杨梅雄株遗传多样性及其育种应用的探索杨梅一般为雌雄异株植物,栽培品种为雌株,其研究报道较多,而雄株很少受到关注。在本研究中调查统计了139份杨梅雄株花序的颜色与形状特性,同时利用13对多态性SSR标记对其遗传多样性进行分析,并与具有代表性的91份雌株群体做对比研究,结果发现杨梅雄株花序按照色泽差异可分为黄绿色、黄红色与红色三种类型;而按照形状差异可分为棒形、圆柱形与长圆锥形;其中黄红色及长圆锥形类型占绝大部分。杨梅雄株群体等位基因数量,期望杂合度(He)及多态信息含量(PIC)的均值都略低于雌株群体,但两者差异不显著(P>0.05)。同时在杨梅雄株群体中发现了10个稀有等位基因;根据UPGMA聚类结果表明,具有相同地域来源的杨梅雄株及雌株表现为亲缘关系较近;我们分别在两个杨梅品种荸荠与丁岙上发现了单个枝条雄花突变现象,而在东魁品种上出现较多的雄花,这些花粉可用于杨梅杂交育种研究。3.不同性别类型杨梅花粉特性观测利用10对多态性SSR引物构建了慈溪杨梅雄株、雌株突变雄枝、雌雄同株三种性别类型杨梅植株的指纹图谱,结果发现雌株突变雄枝类型植株为荸荠品种。三种性别类型杨梅花粉经扫描电镜观测结果表明,花粉大小为(22.90-23.63)×(20.27-22.10)gm,具有直径2.90-3.03μm的萌发孔3个,且无显著性差异;花粉外壁呈颗粒状且分布均匀。使用花粉发芽法与碘-碘化钾染色法对花粉的生活力测定发现,雌雄同株类型花粉生活力为最高;最适宜花粉萌发的培养基为5%蔗糖、0.01%硼酸和1%琼脂。
其他文献
<正> 我国传统企业民主管理中普遍存在的问题是理论与实际脱节,主要表现在职工对理论意义上的“主人翁”地位的认识观念比较淡漠,因而影响了他们的积极性、智慧和创造力的发
可再生能源的开发和利用有利于强化能源安全,有利于应对气候变化和保护生态环境,有利于推动经济发展和创造就业机会,有利于维系能源价格的稳定。巴西地大物博,气候条件良好,
杂环化合物是一类广泛存在于各种天然产物、农药、医药以及功能材料分子中的重要核心骨架。在合成化学领域与医药行业中,对于杂环化合物的合成已成为当前研究的热点。然而从
<正> 化疗是治疗恶性肿瘤的主要治疗方法之一。但在治疗过程中会产生一些不良反应,特别是骨髓抑制,产生白细胞减少症,往往因此而影响肿瘤治疗的进行。近2年来我们随机分组对
<正> 企业民主管理是社会主义条件下劳动者依照法律规定,以主人翁身份参加企业管理的一系列工作总称。它是促成劳动者和生产资料直接结合,从而创造效益的最有效途径。企业实
《千岛日报》是目前印尼发行量较多、销行地区较广泛、影响面较大的华文报纸之一。其华文教育版以"华文园地"和"童心"为代表,不仅形成了自身的版面特色,而且在调整中不断革新
<正> 丹麦,这个童话大师安徒生的故国,其独特的文化氛围孕育了一批批世界级的设计大师,从阿纳·雅各布森(ArneJacobsen)到伍重(Joern Utzon),他们一脉相承的独特设计理念有着
民用无人机应用的高速发展也带来许多安全问题,通过对一些无人机安全事故的分析,发现在技术上、法律上、管控措施上民用无人机存在很多的漏洞和监管空白,需要社会各界协作共
随着可持续发展战略的实施,环境保护越来越受到重视,国家环境保护部开展了创建国家环境保护模范城市的活动。创建环保模范城市活动是以改善城市环境质量和促进经济发展为出发