调节蛋白SrpA控制铜绿假单胞菌多种重要途径表达及噬菌体感染机制研究

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噬菌体有一个必需的基因装备确保它们的入侵、复制和生产。这些必需基因一部分是噬菌体基因组上的基因,另一部分来源于宿主菌的基因。本研究中,构建铜绿假单胞菌PAK-AR2的Tn5G转座子文库,筛选耐受噬菌体K5的突变株,并通过反向PCR鉴定Tn5G在PAK-AR2基因组上的插入位点。在此过程中,我们筛选到一株吸附率不变的耐受突变株,该突变株被插入基因是铜绿假单胞菌基因组上的未知功能的基因。该基因编码一个84个氨基酸的小分子蛋白,生物信息学分析该蛋白是可能的转录调控因子。凝胶阻滞实验证实,该结合蛋白结合噬菌体基因组RNA聚合酶基因的上游区-201到-183序列结合,与噬菌体RNA聚合酶共同作用促进RNA聚合酶的表达。噬菌体部分基因转录需要RNA聚合酶完成,如噬菌体DNA聚合酶、主要衣壳蛋白、主要基板蛋白、磷酸二磷酸还原酶等关键基因。因此,噬菌体的感染过程需要该蛋白和噬菌体RNA聚合酶共同参与。同时,通过对转录组学数据分析,该基因影响铜绿假单胞菌基因组上820个基因的转录水平,对差异表达的基因进行分类,并对影响显著的几个重要系统进行实验验证。结果显示,突变株的Ⅲ型分泌系统表达下降,效应蛋白分泌减少。Ⅵ分泌系统表达水平升高,对大肠杆菌的杀菌能力明显增强。突变基因对维持铜绿假单胞菌运动能力具有重要作用,突变株的群集运动直径远远大于野生型菌株,突变株的Ⅳ型菌毛相关基因表达下降,蹭动运动直径明显变小。同时,该基因促进生物被膜的形成和抑制细菌的趋化性,对细菌适应环境有着重要作用。突变株核糖体表达水平下降,细胞生长变慢,再加上细胞重要系统表达变化,使细胞毒力因子表达下降,杀死秀丽线虫能力减弱。综上,该小分子蛋白为铜绿假单胞菌的基因组上的全局调控因子,因此我们将编码该蛋白的基因命名为srpA(Small regulator protein A),该基因不仅对噬菌体感染起着重要作用,同时控制铜绿假单胞菌多个重要代谢途径的表达,是治疗铜绿假单胞菌感染最有前景的药物靶点。
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