自2016年以来,在新疆发现了一种新的棉花茎腐病害,该病害在潮湿情况下,茎秆病部可产生纵裂和表皮组织崩溃等腐烂症状;在干燥情况下,病斑扩展明显变慢,甚至不再扩展,呈现坏死斑症状,严重时会导致茎秆枯死。该病害目前暂未报道,故进行了此项研究。（1）在新疆主要棉花产区采集茎腐病株,采用常规组织分离法和稀释分离法对病样进行分离、纯化。通过致病性测定、形态学和分子生物学方法对所得的供试菌株进行病原鉴定。明确了引起新疆棉花茎腐病病原菌为变红镰刀菌Fusarium incarnatum和层出镰刀菌F.proliferatum。其中F.incarnatum为优势种。（2）测定不同培养基、温度、光照和p H条件下对病原菌的生长和产孢的影响,确定病原菌孢子和菌丝的致死温度。结果发现马铃薯蔗糖琼脂和马铃薯葡萄糖琼脂均有利于2种镰刀菌的生长和产孢。在20～30℃、p H 7～8和全光照条件下有利于2种镰刀菌的生长,黑暗条件下有利其产孢。F.incarnatum孢子、菌丝致死温度分别为48℃（10min）、50℃（10min）;F.proliferatum孢子、菌丝致死温度分别60℃（10min）、61℃（10min）。（3）通过菌丝生长速率法测定5种常用杀菌剂对病原菌的毒力,结果表明供试5种药剂对F.incarnatum的EC50从小到大依次是97%吡唑醚菌酯<98%多菌灵<98%啶酰菌胺<96%腐霉利<96%嘧霉胺。供试5种药剂对F.proliferatum的EC50从小到大依次是98%多菌灵<97%吡唑醚菌酯<96%腐霉利<98%啶酰菌胺<96%嘧霉胺。故室内药剂实验发现98%多菌灵和97%吡唑醚菌酯对2种病原菌有良好抑制效果。（4）通过小区人工接种进行新疆主栽陆地棉品种对病原菌的抗性研究。接种变红镰刀菌后,以欧式距离10作为聚类距离分割点,将供试品种分为4个抗病（R）品种、6个中抗（MR）品种和5个感病（S）品种,其中新陆早54号、新陆早56号、新陆早52号和新陆早69号表现为抗病（R）品种;新陆早64号、新陆早66号、新陆早55号、新陆早65号和新陆早63号表现为感病（S）品种。接种层出镰刀菌后,以欧式距离10作为聚类距离分割点,将供试品种分为3个抗病（R）品种、7个中抗（MR）品种和5个感病（S）品种,其中新陆早54号、新陆早70号、新陆早52号表现为抗病（R）品种;新陆早57号、新陆早65号、新陆早58号、新陆早63号和新陆早59号表现为感病（S）品种。