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背景:甲状腺癌是一种常见的内分泌系统恶性肿瘤,近年来,因超声等影像检查在甲状腺体检中的常规应用,亚临床型甲状腺肿瘤的患者明显增加,甲状腺癌也因此成为增长最快的肿瘤之一。其中,甲状腺乳头状癌占所有甲状腺癌的80%以上,引起了人们的广泛关注。近些年来,长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤生物学研究中占据越来越重要的地位。关于lncRNA具有促癌或抑癌的作用,以及在转录水平调控蛋白的表达的研究报告屡见不鲜,lncRNA作为生物标志物可在恶性肿瘤诊断和预后中发挥作用。然而,lncRNA在甲状腺乳头状癌中的作用却较少报道。目的:筛选和研究甲状腺乳头状癌差异表达lncRNA及相关mRNA,探索其在甲状腺乳头状癌发生发展中的功能,以及与患者临床特征的相关性,为甲状腺乳头状癌中lncRNA的作用研究奠定基础。方法:应用二代高通量测序方法检测甲状腺乳头状癌和癌旁组织中lncRNA和mRNA表达谱的差异,根据表达量的p值挑选差异基因,并应用定量PCR的方法验证确定。检测下调表达lncRNA NONHSAT076749对甲状腺乳头状癌细胞增殖、迁移和侵袭功能的影响。分析差异基因参与的信号通路,同时计算差异lncRNA与差异mRNA的相关关系,通过分析共表达的mRNA解析lncRNA的潜在功能。结合患者的临床特征,分析差异基因的在不同临床分组中的分布,验证临床特征相关性lncRNA。检测甲状腺乳头状癌组织中BRAF V600E突变状态,分析BRAF突变相关性的差异lncRNA表达及功能。结果:在12对测序样本中,相对于癌旁组织,RNA-seq检测发现半数以上甲状腺乳头状癌标本中共有188个差异表达lncRNA和505个差异表达mRNA(差异倍数>2,p<0.05)。在31对验证标本中,应用定量PCR方法确定了 47个lncRNA和39个mRNA的表达差异。差异表达lncRNA NONHSAT076749下调表达后,对PTC细胞体外增殖、迁移和侵袭能力无明显影响。本研究分析了差异lncRNA与mRNA的共相关关系,并构建了共表达网络图。进一步分析表明这些差异lncRNA主要通过调控共表达的mRNA,影响其参与的ECM-receptor interactions 和 focal adhesion pathway 等信号通路,调控甲状腺乳头状癌的发生发展。结合临床病理特征发现,lncRNA在甲状腺乳头状癌中存在差异性分布,差异lncRNA主要集中在淋巴结转移组或非微小癌组。lncRNA NONHSAT076747、NONHSAT122730和 NONHSAT007318等9个lncRNA是淋巴结转移相关lncRNA;而lncRNANONHSAT130622的表达与肿瘤大小呈负相关。比较分析BRAF基因突变组和野生组间的lncRNA表达差异,建立BRAF突变相关lncRNA表达亚谱。在PTC细胞中,干扰BRAF基因表达可调控BRAF突变相关lncRNA的表达。进一步分析显示这些BRAF突变相关基因多数富集在p53信号通路。结论:本研究应用第二代高通量测序检测方法和生物信息学的分析方法,解析了甲状腺乳头状癌lncRNA表达谱的变化,为甲状腺乳头状癌的转录组信息特征提供了新的内容和观点。甲状腺乳头状癌相关的NONHSAT130622、NONHSAT076747和NONHSAT122730等lncRNA,在PTC的诊断和治疗方面具有潜在的靶点作用。BRAF突变相关的lncRNA差异表达的发现对甲状腺乳头状癌分子分型具有重要价值。