耐高温纤维水解酶的研究

来源 :南京林业大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:vkw74
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本文对Thermotoga maritima ATCC43589极耐热内切葡聚糖酶Cel12B进行了耐热机理与催化机理的探讨以及CBD融合表达研究;对Thermotoga thermarum DSM5069的极耐热木聚糖酶A(B)、β-木糖苷酶、β-甘露糖苷酶和阿拉伯多糖酶进行了基因克隆、表达和酶学表征等的研究。论文取得的主要结果有:(1)对19条12家族的极耐热内切葡聚糖酶的序列进行了比对分析,结果显示Cel12B氨基酸序列中Gly30、Pro63、Pro83、Trp115、Glu131、Met133、Trp135、Trp175、Gly227和Glu229是保守氨基酸。其中Glu131和Glu229为催化活性氨基酸;Gly30、Pro63、Pro83和Gly227与维持蛋白结构的稳定性有关;Trp115、Met133、Trp135和Trp175与底物结合相关。利用反向PCR技术对Cel12B功能氨基酸进行鉴定,结果显示,P63K、P83K和M133W的突变均导致酶活力的损失,证实了Pro63、Pro83和Met133与维持蛋白结构稳定性或与底物结合能力有关。(2)利用PCR技术将极耐热葡聚糖酶Cel12B与T. maritima和T. thermarum的木聚糖酶N端CBD基因融合,获得CBD1、CBD2、CBD3和CBD4共4种融合蛋白。研究结果表明,4种融合蛋白对结晶纤维素都有一定的吸附效果,其中,CBD4吸附性能最好。此外,4种融合蛋白的最适温度和pH值较未融合前都有一定程度的下降,并对金属离子变得更为敏感。底物特异性结果显示,CBD1、CBD2、CBD3和CBD4对结晶纤维素显示出一定的酶活,但对CMC的酶活均有明显的下降。(3)利用PCR方法从极端嗜热菌T. thermarum基因组DNA中克隆了基因xyn10B,共1095个碱基对,编码成熟肽为344个氨基酸,理论分子量为40531Da,并在E. coli中高效表达。Xyn10B木聚糖酶的最适温度和pH值分别为80℃和6.0,当该酶在75℃保温2h后,残存酶活为60%。Km、kcat和kcat/Km分别为1.8mg mL-1、519.6s-1和288.7mLmg-1s-1。TLC检测2h降解产物主要为木二糖、木三糖、木四糖、木五糖和木六糖。(4)利用PCR方法从极端嗜热菌T. thermarum基因组DNA中克隆了基因xyn10A,共3474个碱基对,编码1158个氨基酸。根据分析氨基酸序列的同源性、疏水基团和3D结构,该木聚糖酶属于糖苷水解酶10家族,且包含5个碳水化合物结构域。Xyn10A木聚糖酶在E. coli BL21(DE3)成功表达,比酶活高达145.8U/mg。该木聚糖酶的最适温度和pH值分别为95℃和7.0;添加终浓度5mM Ca2+于pH4.0-8.5和55-90℃的条件下,Xyn10A木聚糖酶均表现出良好的稳定性。水解产物经离子色谱分析(Ion ChromatographySystem),主要为木糖、木二糖、木三糖、木四糖、木五糖和木六糖。本研究的Xyn10A是一种极耐热且具有良好热稳定性的木聚糖酶,因此可用于降解木质纤维原料生产低聚木糖等。(5)利用PCR方法从极端嗜热菌T. thermarum基因组DNA中克隆了基因Tth xynB3,共2322个碱基对,编码774个氨基酸并于E. coli BL21(DE3)中表达。NJ和MP系统发育树显示Tth xynB3是糖苷水解酶3家族的一新β-木糖苷酶。该酶的最适温度和pH值分别为95℃和6.0, pH值稳定的范围为5.0-7.5,在85℃的半衰期为2h。以p-nitrophenyl-β-D-xylopyranoside(pNPX)为底物,Km、Vmax和kcat/Km分别为0.27mM、223.3U/mg和1,173.4mM-1s-1;以p-nitrophenyl-α-L-arabinofuranoside (pNPAF)为底物,Km、Vmax和kcat/Km分别为0.21mM、75U/mg和505.9mM-1s-1。Tth xynB3β-木糖苷酶对木糖有极强的耐受力,Ki大约为1000mM,木糖浓度小于500mM的条件均能促进酶活力。当木糖浓度大于500mM时,酶活力逐渐降低;当木糖浓度达到1000mM时,酶活力约为初始酶活的50%。Tth xynB3β-木糖苷酶显示出良好的降解性能,在包含5%的底物、0.3U酶的200μL反应体系中,低聚木糖3h水解产物主要为木糖。综上所述,本研究提供了一个新颖的且具有潜在应用价值的β-木糖苷酶,拥有较高的木糖耐受性、高的催化活性和热稳定性等诸多优良酶学性质。(6)利用PCR方法从极端嗜热菌T. thermarum基因组DNA中克隆了基因Tth man5,共1827个碱基对,编码608个氨基酸并于E. coli BL21(DE3)中表达。通过系统发育和氨基酸序列比对分析,Tth Man5是糖苷水解酶5家族的一种新的β-甘露糖苷酶。该酶的最适温度和pH值分别为85℃和5.5,pH值稳定的范围为5.0-8.5,在90℃时的半衰期为2h。以p-nitrophenyl-β-D-mannopyranoside(pNPM)为底物,Km、Vmax和kcat/Km分别为4.36±0.5mM、227.27±1.59μmol min-1mg-1和441.35±0.04mM-1s-1;以1,4-β-D-甘露聚糖为底物,Km、Vmax和kcat/Km分别为58.34±1.75mg mL-1、285.71±10.86μmol min-1mg-1和41.47±1.58s-1mg-1mL。Tth Man5对甘露糖具有较好的耐受性,Ki为900mM。综上所述,本研究提供了一种具有某些优良性质的β-甘露糖苷酶(较强的甘露糖抵抗和耐高温性能),因而可作为甘露聚糖酶法转化的一种有效工具酶。(7)阿拉伯多糖是一种重要的植物多糖,其降解主要需要内切阿拉伯多糖酶和α-L-阿拉伯糖苷酶。本研究中对T. thermarum的一种新的内切阿拉伯多糖酶进行了定性及应用研究。获得E. coli BL21(DE3)高效表达的重组Tth Abn阿拉伯多糖酶,后经由热处理和Ni柱亲和层析进行纯化。该酶的最适温度和pH值分别为75℃和7.0;在75℃或80℃保温2h,残存酶活大于80%。研究结果表明,此阿拉伯多糖酶在高温下可以有效降解阿拉伯多糖,Km、Vmax和kcat分别为12.3±0.15mg mL1、588.3±7.1μmol mg1min1和495.4±5.9s-1
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