microRNA在慢性淋巴细胞白血病凋亡抑制通路中的作用研究

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第一部分慢性淋巴细胞白血病microRNA表达谱芯片筛选及验证目的:研究证实microRNA(miRNA)与慢性淋巴细胞白血病(CLL)发生发展密切相关,起类似于抑癌基因和癌基因的功能。本研究通过miRNA表达谱芯片筛选在CLL细胞及正常B细胞差异表达的miRNA,并运用实时定量PCR(RQ-PCR)进行验证,并探讨CLL中部分miRNA的表达及预后意义。方法:运用Agilent miRNA芯片对来自6例CLL患者的CD19+肿瘤细胞及30例正常人外周血的淋巴细胞进行miRNA表达差异筛选;提取156例CLL患者外周血标本总RNA,以cDNA为模板进行10倍梯度系列稀释,分别作miRNAs及内参U6RNA的标准曲线并计算扩增效率,设计stem-loop茎环逆转录引物,运用ABI7300定量PCR仪定量检测,采用SYBR Green荧光染料法,循环阈值(Ct)比较法对miRNA表达行相对定量分析,检测CLL细胞miR-15a、miR-16-1、miR-29b、miR-181a及miR-181b的表达水平;采用PCR联合DNA序列测定p53突变和免疫球蛋白重链可变区(IGHV)突变;应用间期荧光原位杂交(FISH)技术检测患者细胞遗传学异常;多色流式细胞术分别检测CLL细胞CD38和ZAP-70表达。分析目的miRNA表达及与上述预后指标(细胞遗传学异常,IGHV状态,ZAP-70,CD38等预后因素)的关系。结果:miRNA芯片筛选出一系列在CLL及正常对照差异表达的miRNAs(显著上调的包括miR-29a、miR-660、miR-20a、miR-106b、miR-142-5p、miR-101、miR-30b、miR-34a、miR-let-7f、miR-21、miR-155等,显著下调的包括miR-126、 miR-572、miR-494、miR-923、miR-638、miR-130a、miR-181a、miR-181b等);运用RQ-PCR定量发现CLL患者miR-15a、miR-16-1、miR-29b、miR-181a、miR-181b的表达均有不同程度下降。其中,miR-15a/miR-16-1下调与染色体13q14缺失显著相关,miR-29b低表达与IGHV无突变状态显著相关,miR-181a/b低表达与IGHV无突变、CD38阳性、p53缺失和/或突变均显著相关,且与CLL患者总体生存率(OS)及无治疗生存期(TFS)缩短均显著相关。结论:CLL细胞与正常B细胞miRNA表达谱存在显著差异,这些差异表达的miRNA可能参与了CLL的发病机制并与临床预后相关,其中miR-181a/b在CLL表达显著降低且与预后密切相关,可作为后期研究目标。第二部分miR-181s在慢性淋巴细胞白血病凋亡抑制通路中的功能研究目的:部分CLL患者存在p53通路异常,对治疗反应差,并与p53下游BCL-2、TCL-1、MCL-1等原癌蛋白的上调相关。本研究旨在探讨miR-181s在慢性淋巴细胞白血病p53肿瘤抑制通路中的作用。方法:生物信息学方法候选出可能受miR-181s调控,且在CLL显著高表达的抗凋亡基因;构建双荧光素酶报告基因载体,分别构建含有靶基因BCL-2、MCL-1、XIAP3’UTR区的质粒,分别与miR-181a/b mimic、anti-miR-181a/b inhibitor、control mimic共转染耐药细胞株,进行荧光素酶实验鉴定miR-181a/b的靶分子;于CLL原代细胞,分别转染miR-181a、miR-181b及control mimics,用WesternBlot于蛋白水平检测靶基因在转染前后表达变化。40例CLL原代细胞,分别转染miR-15a、miR-16-1、miR-34a、miR-181a、miR-181b mimics后予氟达拉滨处理,培养48小时后流式细胞仪Annexin/PI双染法检测细胞凋亡率改变;PCR联合DNA序列测定p53基因突变,荧光原位杂交(FISH)技术检测40例患者p53及ATM基因缺失情况。结果:双荧光素酶报告实验显示miR-181a/b对BCL-2,MCL-1及XIAP均有显著抑制作用;western blot证实瞬时转染miR-181a/b模拟体后CLL原代细胞的BCL-2,MCL-1及XIAP蛋白表达较转染control组显著下调;40例CLL患者原代细胞,其中10例伴有p53基因缺失和/或突变,30例p53基因正常。流式凋亡检测显示在p53正常组,转染miR-34a、miR-181a、miR-181b mimics后均可显著增强CLL细胞对氟达拉滨的敏感性,而在p53缺陷组,转染各组miRNA后CLL细胞对氟达拉滨的敏感性无明显增加。结论:miR-181a/b低表达与CLL患者不良预后相关,在p53基因正常的CLL肿瘤细胞,恢复miR-181a/b的表达可通过直接负性调节BCL-2/MCL-1/XIAP原癌蛋白显著增强CLL细胞对氟达拉滨的敏感性,从而克服CLL细胞的继发性耐药。第三部分Dicer及Drosha表达在慢性淋巴细胞白血病预后意义研究目的:Dicer及Drosha是成熟miRNA形成过程中的关键剪切酶,其异常表达可致miRNA表达的广泛失调。本研究通过实时定量PCR(RQ-PCR)技术检测慢性淋巴细胞白血病患者Dicer及Drosha的表达,研究CLL中Dicer及Drosha的表达及其与其他临床指标(包括临床分期,细胞遗传学异常,IGHV突变状态、ZAP-70、CD38、p53基因异常等因素)间的关系,首次探讨了其在CLL中的预后意义。方法:提取165例CLL患者骨髓或外周血标本,8例单克隆B淋巴细胞增多(MBL)患者及10名健康对照外周血B细胞总RNA,以cDNA为模板进行10倍梯度系列稀释,分别作Dicer,Drosha及内参β-actin的标准曲线并计算扩增效率,运用运用Stratagene Mx3000P定量PCR仪进行定量检测,采用SYBR Green荧光染料法,循环阈值(Ct)比较法对Dicer、Drosha表达行相对定量分析。同时运用荧光原位杂交技术(FISH)检测CLL患者细胞遗传学异常,流式细胞仪检测CD38及ZAP70表达,多重PCR技术检测IGHV突变状态及p53基因突变状态。结果:临床分期较早(Binet A期)的患者Dicer表达水平高于临床分期较晚(BinetB+C期)的患者(mean±SD,0.017±0.010vs.0.015±0.019;p=0.001)。Dicer表达在MBL患者及正常对照B细胞中无显著差异(mean±SD,0.020±0.012vs0.019±0.09)。伴IGHV基因无突变、CD38表达阳性、ZAP-70表达阳性及p53异常(包括ATM缺失、p53缺失及突变)的患者,Dicer表达水平显著低于无以上不良预后因素者,差异显著(p值分别为p<0.0001、p=0.0304、p=0.0075和p=0.011)。Dicer表达水平在伴有单独13q14缺失的患者显著高于其他核型的患者(p=0.0009)。以IGHV突变情况作为标准对Dicer表达水平做ROC曲线分析确定其最佳分界值为0.012(AUC=0.7241,p<0.0001),Dicer低表达组总生存率显著低于Dicer高表达组(分别为132个月及未到达,p=0.0046),Dicer低表达组的无治疗生存期亦显著低于Dicer高表达组(分别为24个月及110个月,p=0.0006)。Drosha表达在以上各组间未发现明显差异,未见明显预后意义。结论:Dicer表达水平与CLL重要预后因素IGHV基因突变、ZAP-70、CD38、p53状态密切相关,在CLL的预后中具有重要价值。
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