大口黑鲈池塘转食过程中肝脏转录组与肠道微生物研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fenghuayi
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近年来,大口黑鲈逐渐成为中国最受欢迎的名优养殖品种之一,已经成为我国“第五家鱼”。转食是大口黑鲈养殖过程中最重要的生产环节,但其仔稚鱼转食成活率不稳定,死亡率高,一直制约着产业的发展。本研究利用第二代测序技术,对大口黑鲈转食三个阶段(转食前、中、后:pre,mid,post-weaning stages)肝脏转录组和肠道微生物进行研究以揭示大口黑鲈在转食过程中的肝脏代谢和肠道菌群的动态变化特征;同时通过消化酶活活性来探讨其转食过程中消化能力的大小及变化。主要结果如下:(1)对转食三个时期肝脏、肠道中三个重要消化酶(胰蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶)检测发现:肠道中三种消化酶在转食中期均出现显著下降(p<0.5);肝脏中淀粉在转食三个时期呈下降趋势,而在肝脏中未检测出脂肪酶和胰蛋白酶。随着转食进程的推进,大口黑鲈前肠道绒毛高度、宽度、肠壁厚度以及吸收面积在转食后显著高于转食前、中期;而肠道在转食中期肠壁厚度最薄和吸收面积最小。(2)通过对三个转食阶段两两之间进行差异表达基因分析,相较于其他两个时期,肝脏中在转食前有156个基因表达较高、260个表达较低;在转食中有60个基因表达较高、20个表达较低;在转食后有206个基因表达较高、165个表达较低。转食前高表达基因富集在胆固醇代谢、维生素消化吸收、氨基酸的生物合成和代谢等通路;转食前低表达基因富集在不饱和脂肪酸的生物合成、PPAR信号通路、脂肪消化吸收等通路。转食中高表达基因富集在环境信息处理、蛋白质消化吸收、运输和分解代谢等通路;转食中低表达基因富集在补体和凝血级联、血小板活化、抗坏血酸和新陈代谢等通路。转食后期高表达基因富集在PPAR信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂肪酸代谢、碳代谢等通路;转食后期低表达基因富集在氨基酸代谢、氨基酸的生物合成、胆汁分泌等代谢通路。(3)三个转食阶段肠道菌群主要分布在厚壁菌门、软壁菌门、梭杆菌门、拟杆菌门、放线菌门、变形菌门和蓝藻菌门。其中变形菌门和厚壁菌门变化最为显著,变形菌门丰度从转食前的56.32%下降到转食中、后阶段的28.91%、16.84%,而厚壁菌门丰度从25.29%上升到60.70%、62.81%。在转食中后期变形菌门中邻单胞菌属、鞘氨醇单胞菌属、不动杆菌属和寡养单胞菌属的丰度下降较为明显,而厚壁菌门中梭菌属丰度增长最为明显。总体而言,本研究揭示了大口黑鲈转食过程中肝脏转录组、肠道微生物及肠道消化酶的动态变化特征,为今后大口黑鲈转食研究提供一定的依据和参考。
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