人免疫缺陷病毒-型( HIV-1)是造成全球AIDS流行的主要原因。在亚洲，HIV-1 B亚型、CRF01_01AE和C亚型是三大主要流行亚型，其中，B亚型可分为两类，一类与欧美流行的B亚型相似，而另一类则在系统发育树上形成独特单种系簇被称为B’。普通B亚型在亚洲传播稳定，而B’的影响范围广泛，涵盖了金三角及其周边地区，并且B’与其他亚型共流行于这一地区，催生了多种新兴的重组型病毒，这些病毒在亚洲的HIV-1流行趋势中扮演着越来越重要的角色。因此，B’无论在过去或者未来都影响着HIV-1在亚洲流行的走势，B’对亚洲HIV-1的多样性格局有着重要的意义。然而，关于B’的信息却十分模糊。1988年，在泰国曼谷的静脉吸毒者人群中突然爆发了大规模的HIV-1 B亚型感染，后续研究表明造成这次大流行的B亚型病毒不同于之前在该人群中发现的类似于欧美的B亚型，新毒株被定名为B或者Thai-B。这是关于B的首次报道，但B的起源、B’以怎样的分子特征区别于其他B亚型、是否有抗原特异性却无从得知。　　 由于早期HIV分型依赖gag p17和env V3区，HIV序列以这两区最为丰富，为了获得最大规模的种群随机样本，本文由B’的原始定义出发，从LANL HIV数据库和GenBank盲选出了所有涵盖p17和V3区的B’序列。由这些序列编辑了若干数据组进行B’的家系关系传播历史重建和分子特征性位点的分析。本文对B’家系关系和传播历史的重建基于敛聚理论。我们选取D亚型和全球各地具有代表性的B亚型毒株作为参考，将B’序列同这些参考序列一起重建D/B/B’之间的家系发展关系，由已知的HIV-1传播历史节点作参照，以找寻可能的B’来源。此外，作者从筛选得到的B序列中选取具有最适时空代表性和基因长度的序列组成四个数据组用以B’传播历史的重建，重建分无参数估计和有参数估计两部分。　　 由于大多数B’序列长度有限，因而对B’特征性位点的研究主要集中在p17和C2V3位置。本文搜集了所有的HIV-1亚型序列，用Perl语言自编程序计算了各亚型的共有序列以及各个位点的保守性。鉴于B’与B亚型的密切关系，对B’的特征性位点研究主要关注B同B亚型相异的位置，在B中保守性达70％以上的差异性位点被认为是B的特征性位点。　　 结果显示，B的传播起源始于上世纪80年代中期，其爆发性扩散具有明显的奠基者效应特点。作者在Gag蛋白的1-161区域内确定了9个B的特征性位点，在Env gp160蛋白的268-359区域内确定了8个B的特征性位点。其中Env蛋白的特征性位点集中在受体结合区域周围，暗示了B的抗原特异性。本文首次对B这一亚洲HIV流行复杂性的奠基毒株进行了全面的研究，为流行病学、公共卫生及疫苗设计提供了有价值的参考。