城市污水中病原性大肠埃希氏菌三种毒力基因的定量PCR检测方法

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城市污水再生利用是提高水资源综合利用率、缓解水资源短缺的有效途径之一。然而,污水中存在的大量病原菌,给人类健康造成了很大威胁。病原性大肠埃希氏菌是最常见的一类肠道病原菌,其致病性主要由毒力因子和相关蛋白来体现。这些毒力因子都有相应的编码基因,即毒力基因。基因eaeA编码外膜蛋白—紧密素,它是肠出血性大肠埃希氏菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)和肠致病性大肠埃希氏菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)在肠道黏膜定居并引起粘附与脱落病变所必需的毒力因子。基因rfbE是EHEC O157:H7菌株特有的毒力基因,它编码的脂多糖是该菌株引起腹泻、出血性结肠炎以及溶血性尿毒综合症的主要毒力因子。EAgg是肠聚集性大肠埃希氏菌(enteroaggregativeE.coli,EAEC)特有的毒力基因,表现急性和长期腹泻等症状。目前国内外关于EHEC、EPEC和EAEC的散发及爆发病例时有发生。本研究针对病原性大肠埃希氏菌EHEC、EPEC和EAEC的毒力基因eaeA、rfbE和EAgg,选用特异性引物,建立了实时荧光定量PCR检测方法。利用从污水中分离出的目的核酸片段构建重组质粒,通过测序和BLAST比对分析,确定了PCR扩增的特异性。将重组质粒作为模板,分别测定标准曲线,在基因eaeA模板量8.77×10~0~8.77×10~5copy,基因rfbE模板量4.98×10~0~4.98×10~5copy,基因EAgg模板量5.34×10~1~5.34×106copy的范围内Ct值与模板量的对数值具有良好的线性关系(R~2=0.997,R~2=1.000,R~2=0.996)。结合膜吸附洗脱浓缩方法,对于实际水样,基因eaeA、rfbE和EAgg的检测限分别为1.75×10~2copy/10~0mL、9.96×10~1copy/10~0mL和1.07×10~3copy/100mL。利用建立的定量PCR检测方法对城市污水处理厂的进出水进行检测,结果显示污水二级处理工艺对这两种毒力基因的去除效果明显。利用建立起来的实时荧光定量PCR方法对城市污水进行了检测,对二级出水中的病原性大肠埃希氏菌毒力因子的分布情况进行了简单分析。另外,还利用建立起来的定性和定量PCR检测法对毒力因子的污染源进行了追踪分析,研究发现毒力基因eaeA的污染源主要有鸡、猪和狗;毒力基因rfbE的污染源尚不明确;毒力基因EAgg的污染源主要有猪、狗、羊和鸭。
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