新疆地区盐湖中度嗜盐菌的鉴定及其系统发育分析

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该论文利用16S rDNA序列和DNA同源性分析的方法确定了采自中国新疆地区盐湖的中度嗜盐菌AD-6、C-6、YH-3和D-8的亲缘关系,采用16S rDNA系统发育分析、DNA G+C mol%和DNA-DNA杂交的分子生物学方法,并结合形态特征、生理生化特征的测定以及细胞化学分析法对AD-6和D-8进行鉴定,并且分析了它们的系统发育地位.16S rDNA序列和DNA同源性分析表明,C-6、YH-3和D-8是同一个菌种的不同菌株,它们的16S rDNA相似性为99~100%,DNA同源性在87~92%之间.而AD-6是另一种不同的中度嗜盐菌,它与C-6、YH-3和D-8的DNA同源性分别为35%、47%和50.6%.在Gibbson培养基上,D-8和AD-6生长的NaCl浓度范围分别为0~25%和0~20%.它们的菌体呈杆状,革兰氏染色阳性,以周生鞭毛运动,产生芽胞,产生橙色非水溶性色素.细胞壁肽聚糖为Orn-D-Asp型.D-8和AD-6的Tm值分别为72.3℃和72.7℃,DNA G+C mol%分别为41.4和42.2.上述特征符合S.Spring等对盐芽胞杆菌属(Halobacillus)特征的描述.在以16S rDNA序列为基础的系统发育树中,D-8和AD-6与Halobacillus的成员处于同一分支.BLAST软件分析表明,AD-6和D-8与H.litoralis及H.trueperi的16S rDNA序列相似性为99%,与另一个种H.halophilus的相似性为97%.DNA-DNA杂交结果表明,D-8与H.litoralis、H.trueperi和H.halophilus的DNA同源性分别为52.4%,43.2%,28.7%,而AD-6与上述3个参比菌株的DNA同源性分别为19%,45.5%和38%.建议D-8和AD-6为Halobacillus的新种,分别定名为Halobacillus dabanense (D-8)和Halobacillus aidingense(AD-6).
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