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目前全球有大约1.7-2.0亿人感染HCV,在我国HCV的自然感染率为3.2%。感染HCV后,大部分感染者将发展成慢性感染,还有很大比例的病人最终发展成肝硬化,甚至肝癌,同时由于目前尚无可以治愈丙型肝炎的药物和预防性疫苗问世,因此使得丙型肝炎已经成为继艾滋病之后的又一大严重危害人类健康的传染病。HIV和HCV具有相似的传播途径,因此共感染的几率很高,在不同感染途径所致的HIV感染者中,HIV/HCV共感染率存在很大差异,其中尤其以静脉吸毒所致的HIV感染者中HIV/HCV共感染率最高。目前在我国,静脉吸毒仍然是HIV传播的主要途径,该人群中HIV和HCV的共感染率远高于正常人群,因此研究静脉吸毒所致共感染人群中HCV的分子流行病学特点对于HCV感染的预防和控制具有重要意义。 HCV的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)缺乏校对功能,使得RNA在复制过程中错配率极高,最终导致HCV基因组中核苷酸突变频率极高,为基因分型提供了基础。根据HCV基因组5’NCR、C、NS5B区核苷酸序列的同源性,HCV可分为6个主要基因型,每个型又可分为若干亚型。由于HCV基因型的不同直接影响HCV的致病力和患者对药物治疗的反应性,同时HIV和HCV共感染具有协同致病性,针对该人群的HCV预防性疫苗的研究也需要对HCV基因型的组成和分布有深入的了解,因此本研究对采自云南省德宏、红河、文山、曲靖、昆明和大理六个地州的52例HIV/HCV共感染样品进行了HCV NS5B区部分基因的测序分型,其中部分样品还进行了HCV C区和E区部分基因的测序分型。通过与已有的HCV 5’NC区基因分型结果进行比较,得出以下结论,第一,5’NCR区在基因分型能力上存在缺陷,尤其对于HCV 1型和6型的基因亚型缺乏有效区分的能力,而本研究建立的基于NS5B区的基因分型方法能够弥补该缺陷;第二,云南省静脉吸毒所致HIV/HCV共感染人群中的HCV流行以3型为主,还存在一定比例的6型和混合感染,并且该人群中的HCV基因亚型分布具有明显的地理分布特点,通过与中国内地和周边国家的HCV流行特点进行比较后发现,HCV在该人群中的流行特点与我国内地正常人群甚至静脉吸毒人群中的流行完全不同,反而与HCV在泰国和缅甸等相邻国家的流行情况基本一致,提示与HIV相似,HCV在该人群中的传播与毒品运输密切相关;第三,发现了高比