农民专业合作社的绩效评价已成为自身发展的内在推动力,还不断影响着自身发展的组织性和效率性。因此,烟农专业合作社绩效评价对自身的可持续健康发展同样具有重要的推动和引导作用,而构建一套合理且科学的绩效评价指标体系是烟农专业合作社开展绩效评价的基本前提,而目前理论界和实务界都没有确认一个统一的、广泛认可的烟农专业合作社绩效评价指标体系。本文基于相关理论与文献研究,结合烟农专业合作社特征和绩效生成路径,首次构建了基于“行为—产出绩效观”的湖南省烟农专业合作社绩效评价指标体系；然后运用层次分析法确定指标权重,以随机抽样方法获取的湖南省50个烟农专业合作社为样本,计算综合绩效分值并排名；接着采用因子分析方法对绩效评价指标体系进行了二次验证,以相同的样本计算出一个综合绩效分值并排名；最后将得到的两组综合绩效分值和排名进行对比分析。结果表明：本文构建的21个绩效评价指标基本上容纳了全部可能影响合作社绩效的指标的绝大部分信息；同时两组排名变动的差异不显著,表明构建的绩效评价指标体系是有效的、合理的。文章还提出了有效运行湖南省烟农专业合作社绩效评价体系的6个建议。