目的——开发一种基于孕妇血浆测序的胎儿性别鉴定方法，评价其作为筛检试验的可能性，及其在性连锁遗传病咨询中的应用潜能。方法——选取900例孕周为12-16周的、已知出生随访结果的孕妇血浆测序数据进行回顾性分析，其中训练集和验证集分别为100例和800例。统计比对到Y染色体上的测序片段的百分比，基于ROC曲线方法选取性别鉴定分界值，并用于鉴定胎儿性别。招募8例杜氏肌营养不良症的携带者孕妇进行同步盲法测试，通过孕妇血浆测序，利用所建立的方法进行胎儿性别鉴定。对性别鉴定错误样本进行全面的回顾分析，包括常染色体数目异常检测及临床记录。其中，常染色体数目异常检测通过建立引入内部参考染色体的Z检验方法进行。结果——在训练集中，本方法对胎儿性别鉴定的灵敏度和假阳性率分别为96%和0%。在验证集中，423例男胎中421例成功鉴别，377例女胎中374例成功鉴别，灵敏度及特异性达到99.53%和99.20%，其余各项评估指标均达到筛检试验要求。与羊水穿刺金标准对比，8例杜氏肌营养不良症携带者的胎儿性别鉴定均正确。引入内部参考染色体的Z检验方法对T13、T18和T21的检测灵敏度为100%，特异性为98.7%，100%和100%。使用该方法筛查所有5例性别鉴定错误样本，结果均为阴性。另外，该错误样本与孕周、孕妇年龄、唐氏风险和妊娠异常病史均没有直接关系。结论——基于孕妇血浆测序，无创性的胎儿性别鉴定可达到高准确率。本方法在具有完善的伦理学考量的前提下，具有产前遗传咨询的应用前景。