【摘 要】
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肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）是常见的消化系统恶性肿瘤,肝癌的发生与病毒感染、家族遗传、生活习惯等因素息息相关,目前医治肝癌主要采用手术切除、化疗和放疗联合使用的方式。由于肝癌发生发展机制复杂,尚未完全阐明,肝癌患者的治疗效果往往不佳。因此有必要深入研究肝癌的发病机制,探寻新的分子靶点用于肝癌的诊断与治疗。本研究中,我们首先从GEO数据库中获取三套肝癌基因表达
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肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）是常见的消化系统恶性肿瘤,肝癌的发生与病毒感染、家族遗传、生活习惯等因素息息相关,目前医治肝癌主要采用手术切除、化疗和放疗联合使用的方式。由于肝癌发生发展机制复杂,尚未完全阐明,肝癌患者的治疗效果往往不佳。因此有必要深入研究肝癌的发病机制,探寻新的分子靶点用于肝癌的诊断与治疗。本研究中,我们首先从GEO数据库中获取三套肝癌基因表达谱数据（GSE65485、GSE104310、GSE124535）,标准化预处理后用R语言筛选得到差异表达基因（Defferential Expressed Genes,DEGs）,作为进一步研究对象。通过STRING获得DEGs的蛋白质互作关系网络（protein-protein interaction network,PPI network）,经过Cytoscape中的MCODE插件进行模块处理得出模块基因（module genes）,经过Cytohubba进一步处理,根据Degree得分识别出15个表达上调的关键节点基因（Hub genes）。通过基因功能注释分析（Gene ontology,GO）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析,我们发现这些基因主要富集在与细胞有丝分裂、细胞器分裂和卵母细胞减数分裂相关的信号通路。生存分析和表达分析显示,Hub genes中CDK1、CCNB1、CDC20、BUB1、MAD2L1、BUB1B、AURKB、RRM2、UBE2C过表达的肝癌患者总生存率明显低于对照组,且上述基因在肝癌组织的表达高于癌旁和正常组织。我们的实验结果提示上述基因与肝癌的病程发展有关,或可将其作为肝癌临床诊断和治疗的靶点。
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