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随着经济全球化的趋势不断加快,创新能力正日益成为衡量一个国家综合国力的重要指标。2006年,我国提出了建设创新型国家的重大战略,全国各地都在积极建立和完善区域创新体系,城市是区域发展的核心,研究城市的创新体系以及创新系统,建设创新型城市,对实现我国创新型国家的战略具有重大意义。高新技术产业是我国经济发展的战略性产业,其产业发展水平的高低,关系到国家或地区竞争力的强弱,也决定了其今后发展的潜力和持续性。在创新成为城市发展核心驱动力的环境下,高新技术产业在创新型城市建设过程中发挥着不可替代的作用,因为高新技术产业作为一种创新型产业具备很强的自主创新能力,而且产业关联性和渗透性强,因此其创新成果容易扩散,它的创新和发展能够有效地带动其他产业的发展。高新技术产业的发展对创新型城市的建设具有很强的推动作用,研究两者之间的互动关系,对我国经济社会的发展有重要的意义。本文在发展经济学、区域经济学以及系统论为基础,运用理论研究法、实证研究法以及定性分析和定量分析相结合等研究方法,论述了国内外对高新技术产业以及创新型城市的相关研究现状,总结了目前研究存在的问题,发现很少有学者对高新技术产业和创新型城市之间的互动关系进行系统的研究。因此,本文的重点就是研究高新技术产业与创新型城市之间的互动关系。并运用系统动力学的方法,建立了高新技术产业与创新型城市之间的创新互动系统。通过该方法分别探讨了高新技术产业子系统和创新型城市子系统的构成及其内部机制,进一步分析了系统内部各组成要素之间的因果反馈关系,根据因果反馈环的极性为正证明了整个复杂性系统的极性为正,所以两个子系统之间是相互促进呈螺旋上升的趋势。此外,本文引入了信息熵评价了系统的有效性,弥补系统动力学对系统有效性无法进行综合评价的缺陷。通过对武汉的实证研究验证了高新技术产业与创新型城市之间组成的复杂系统是有效的,并据此分析两个子系统之间存在的问题,以此为依据为政策的制定提供支持,以有助于武汉及全国其他城市创新型城市的建设和高新技术产业的发展。