基于TCGA数据库研究CXCL5与肝癌预后及肿瘤微环境的关系

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目的:探索与肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后及肿瘤微环境相关的调节因子,为肝癌早期诊断、预后的预测及肿瘤精准治疗开拓新的可能。方法:使用R软件中的“ESTIMATE”算法,对来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的374例HCC患者的免疫和基质评分结果进行了测算,评分结果代表免疫和基质成分在肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中的相对含量,利用差异表达分析筛选出高低评分组之间表达有差异的基因。通过COX回归分析和蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建,分析差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),确定CXCL5作为预测因素,最后我们研究了CXCL5表达水平对肝癌患者预后、病理分期及TICs的影响。结果:CXCL5的表达在肝癌组织和正常组织中存在差异,且与HCC患者的生存、TMN分级均存在相关性。CIBERSORT分析结果显示CXCL5的表达与活化NK细胞比例、M0巨噬细胞比例、静息状态肥大细胞比例、中性粒细胞比例相关。结论:CXCL5是潜在的肝癌预后标志物,此外,CXCL5的表达水平与TICs比例相关,提示其在肿瘤微环境中的重要作用。
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