我国煤炭行业频发的矿难事故造成了严重的人员伤亡以及巨大的经济损失，煤炭行业安全生产问题突出。探索我国煤炭行业矿难事故的影响因素，研究煤炭企业管理方面存在的主要问题，有利于降低矿难事故的数量，减少矿难事故造成的经济损失。本文结合事故致因理论，从专业管理、人力资源管理、领导者等煤炭企业内部因素构建研究框架，对矿难事故的影响因素进行系统性分析。通过多种途径收集1990-2009期间我国煤炭行业发生的特别重大矿难事故的相关信息共99条。根据研究框架对矿难事故间接原因的文字性描述进行编码处理，获取样本数据。在此基础之上，对数据进行深入分析，探索影响特别重大矿难事故的主要因素。研究表明：不同所有制形式的煤炭企业在矿难事故的遇难人数以及经济损失方面存在一定的差异。我国煤炭企业内部存在着严重的管理问题。其中，煤炭企业的专业管理在安全管理、技术管理、设备管理以及制度管理方面均存在着严重的不足；人力资源管理在培训方面的问题较为突出；超能力生产对煤炭行业矿难事故造成的遇难人数以及经济损失有显著性影响。最后，本文针对煤炭企业内部管理问题，提出了相关的改进建议和措施。