1937年11月19日,苏州沦陷,开始遭受日军的殖民统治。日军占领苏州后,政治上在占领区内普遍建立伪政权;经济上,开始进行疯狂的物资掠夺。其着手建立的苏州商会就是为了配合对苏州物资的搜刮和掠夺,也是日军统制苏州的一个具体措施。苏州沦陷后,之前的苏州商会基本处于解散状态。日伪从1938年开始筹备重建苏州商会,经过3年多的筹建,直到1941年7月,新的商会才得以建立,称为吴县县商会。沦陷时期的苏州商会在组织制度方面,基本保留沦陷前的较为民主的组织制度,但在实际操作中,更多的是服从日伪的意志。由日伪建立的吴县县商会与沦陷前的苏州商会相比,在政治、经济、社会各方面职能的发挥都相差甚远。沦陷时期的苏州商会,成为日伪搜集物资,进行经济统制的协助者。在协助日伪统制过程中,沦陷时期的苏州商会采用主动向日伪反映商艰的方式,维护商民的利益,但是只要稍稍触犯日伪统制利益,就会遭到日伪的拒绝。在日军的严密管理下,沦陷时期的苏州商会成为日军在华殖民统治、控制中国工商业的协助者。