塔里木蟾蜍是我国新疆干旱地区特有物种之一。迄今为止没有关于该物种遗传多样性的报道。塔里木蟾蜍是新疆广布两栖物种，对它的系统地理结构和群体遗传分化研究将有助于了解这一地区历史生物地理学，对该地区两栖动物群体分化和历史进化过程提供有益资料。 本研究以新疆天山两侧采集到的67只塔里木蟾蜍标本为实验材料，利用线粒体DNA(mtDNA)ND1(NADH dehydrogenase subunit 1)部分基因、ND2(NADHdehydrogenase subunit 2)部分基因及中间三个tRNA基因共972bp序列，和D-loop854bp序列，分析塔里木蟾蜍群体mtDNA遗传多样性和系统地理结构；以土耳其绿蟾蜍(B. variabilis)，伊朗绿蟾蜍(B.luristanicus)作为外群，采用最大简约法(MP)和贝叶斯方法(BI)构建种内单倍型系统发育关系。取得以下主要成果： 1.塔里木蟾蜍存在丰富的遗传多样性，且哈密地区的遗传多样性最高。 2.我们支持帕米尔蟾蜍(Bufp taxkorensis)和塔里木蟾蜍(Bufopewzowi)为同一物种，因Bufo pewzowi(1999修订为有效种名)的定名早于Bufo taxkorensis(2004)，遵照国际命名法规，后者应该归入前者，即Bufo taxkorensis为Bufopewzowi的同物异名。 3.单基因和联合数据都揭示塔里木蟾蜍存在四个线粒体世系，对应于四个地区：天山东部吐哈盆地，天山南麓博斯腾、天山北麓巴里坤-玛纳斯地区和天山西部伊犁地区。分子变异分析也证明了塔里木蟾蜍存在显著的系统地理结构。 4.哈密地区群体已经产生了较大分化。 5.伊犁洲的塔里木蟾蜍曾经历过一次扩张并且有从伊犁洲向哈萨克斯坦扩散的趋势。 6.塔里木蟾蜍各个世系分歧时间大约在0.55-0.97百万年前。“青藏运动”及“昆-黄运动”造成喜玛拉雅山、昆仑山、天山等山脉强烈隆升，导致蒙新区气候发生极大变化，气候干旱化并形成了沙漠。这一系列强烈的古地质、古气候因素对动物区系演变产生了重要影响。我们推测也是塔里木蟾蜍地理群组间产生分化的主要原因。